89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0041 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
471 aa  963    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  64.94 
 
 
453 aa  615  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  57.68 
 
 
461 aa  536  1e-151  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  56.48 
 
 
457 aa  513  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  54.55 
 
 
450 aa  496  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  55.73 
 
 
449 aa  492  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  54.75 
 
 
453 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  53.17 
 
 
450 aa  488  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  52.04 
 
 
448 aa  468  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  52.48 
 
 
454 aa  468  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  32.25 
 
 
498 aa  276  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  32.57 
 
 
493 aa  269  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 
457 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  30.36 
 
 
518 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  28.84 
 
 
531 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  27.58 
 
 
501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  28.09 
 
 
531 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  28.18 
 
 
448 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  28.9 
 
 
441 aa  192  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  27.46 
 
 
443 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  27.77 
 
 
458 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  36.44 
 
 
530 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  37.34 
 
 
501 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  33.92 
 
 
502 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  36.02 
 
 
519 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  35.06 
 
 
551 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  31.48 
 
 
551 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 
551 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  31.48 
 
 
551 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  31.48 
 
 
551 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  37.56 
 
 
507 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  36.91 
 
 
505 aa  166  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  37.23 
 
 
502 aa  163  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  34.27 
 
 
531 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  34.98 
 
 
524 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  34.43 
 
 
529 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  28.27 
 
 
514 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  37.27 
 
 
500 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  34.55 
 
 
510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 
457 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 
495 aa  143  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  25.11 
 
 
428 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  20.82 
 
 
635 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  23.74 
 
 
459 aa  63.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  25 
 
 
416 aa  63.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
389 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  34.74 
 
 
421 aa  60.5  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  21.83 
 
 
432 aa  58.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5276  major facilitator transporter  25.89 
 
 
505 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  32.63 
 
 
506 aa  51.6  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  43.1 
 
 
467 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  22.96 
 
 
401 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
404 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  23.29 
 
 
481 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.25 
 
 
472 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 
460 aa  48.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  22.6 
 
 
473 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.84 
 
 
469 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  22.6 
 
 
473 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  22.6 
 
 
473 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  22.6 
 
 
481 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  22.84 
 
 
469 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  22.84 
 
 
469 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3542  oligogalacturonide transporter  21.95 
 
 
519 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2444  major facilitator transporter  23.53 
 
 
527 aa  47  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3380  oligogalacturonide transporter  22.27 
 
 
519 aa  47  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  23.88 
 
 
476 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  23.88 
 
 
476 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  23.88 
 
 
476 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  23.88 
 
 
476 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0853  major facilitator superfamily MFS_1  20.22 
 
 
523 aa  46.6  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 
405 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  25 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0819  oligogalacturonide transporter  22.78 
 
 
524 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  30.61 
 
 
479 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  23.88 
 
 
476 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.74 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.32 
 
 
460 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  28.48 
 
 
424 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  25.57 
 
 
461 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  30.68 
 
 
493 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  57.14 
 
 
465 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  22.34 
 
 
416 aa  44.3  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  39.62 
 
 
469 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  27.35 
 
 
460 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
435 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2371  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28 
 
 
447 aa  43.5  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000288768  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>