62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0028 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0028  double-stranded beta-helix-like protein  100 
 
 		 112 aa  231  4.0000000000000004e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  61.61 
 
 		 186 aa  150  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  61.61 
 
 		 186 aa  150  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 197 aa  150  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  61.61 
 
 		 186 aa  150  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  61.61 
 
 		 186 aa  150  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  60.71 
 
 		 186 aa  150  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 186 aa  149  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  44.64 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  36.26 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  36.26 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  36.26 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  36.26 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  36.26 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  35.16 
 
 		 181 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  35.16 
 
 		 181 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  30.91 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  26.8 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 199 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  26.61 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  26.61 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 199 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 199 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  28.97 
 
 		 192 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  30.86 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0791  transcriptional regulator, XRE family  24.77 
 
 		 213 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.49267e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 199 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  33.8 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  27.1 
 
 		 199 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.17 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  24.07 
 
 		 201 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  27.1 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 292 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 333 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0545  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.41 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  24.21 
 
 		 187 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10448  hypothetical protein  38.33 
 
 		 179 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  36 
 
 		 332 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3324  cupin 2 domain-containing protein  26.79 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0599  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1227  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, interruption-C  32.89 
 
 		 257 aa  41.6  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.192593  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3841  cupin 2 domain-containing protein  26.79 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1434  transcriptional regulator, XRE family  24.49 
 
 		 232 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.887851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  26.23 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0361  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2901  DNA-binding protein  25.25 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0118  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  29.17 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  24.32 
 
 		 180 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>