174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3026 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3026  trehalose-phosphatase  100 
 
 		 269 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3613  HAD family hydrolase  85.13 
 
 		 269 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0577  trehalose-phosphatase (trehalose 6-phosphate phosphatase) (TPP)  72.27 
 
 		 277 aa  338  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1027  HAD family hydrolase  69.42 
 
 		 269 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.794711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4524  HAD family hydrolase  70.64 
 
 		 278 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0916  trehalose-6-phosphatase  69.58 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184398  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  69.49 
 
 		 265 aa  329  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3915  HAD family hydrolase  41.23 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1976  HAD family hydrolase  42.59 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  40.26 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0987  trehalose-phosphatase  41.08 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0355  HAD family hydrolase  40 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0200  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40.17 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.673335 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1752  trehalose-phosphatase  39.68 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04867  trehalose-phosphatase  41.08 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.58 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.777067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2473  trehalose-6-phosphate phosphatase  34.45 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2755  trehalose-phosphatase  39.18 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0565  trehalose-phosphatase  38.78 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2815  trehalose-phosphatase  39.18 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  38.78 
 
 		 269 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  39.57 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  38.37 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  38.37 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1722  HAD family hydrolase  37.07 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0503  HAD family hydrolase  37.08 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.874755  normal  0.0247471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0519  trehalose-phosphatase  37.08 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  38.78 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1039  HAD family hydrolase  37.3 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1529  HAD family hydrolase  37.83 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1035  HAD family hydrolase  37.3 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0371  Trehalose-6-phosphatase protein  41.7 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2945  HAD family hydrolase  41.98 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4595  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.81 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2148  HAD family hydrolase  39.35 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524754  normal  0.803634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1468  HAD family hydrolase  37.1 
 
 		 245 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2634  trehalose-6-phosphate phosphatase  35.96 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130078  hitchhiker  0.0000000000001334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01866  trehalose-6-phosphate phosphatase, biosynthetic  35.96 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1745  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.96 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2090  trehalose-6-phosphate phosphatase  36.29 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  4.88107e-23 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  38.43 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  38.43 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1288  trehalose-6-phosphate phosphatase  35.96 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0241592  hitchhiker  0.000000179042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2084  trehalose-6-phosphate phosphatase  37.02 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000038729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0526  HAD family hydrolase  38.68 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01855  hypothetical protein  35.96 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1994  trehalose-6-phosphate phosphatase  35.96 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000553553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2129  trehalose-6-phosphate phosphatase  35.96 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000674264  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1737  trehalose-6-phosphate phosphatase  35.96 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.758934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0949  putative trehalose-6-phosphate phosphatase  42.11 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1192  trehalose-6-phosphate phosphatase  36.71 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0385868  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2609  HAD family hydrolase  42.11 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  36.55 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.55 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1315  trehalose-6-phosphate phosphatase  36.6 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.89318e-19 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4269  HAD family hydrolase  38.78 
 
 		 250 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.582596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1107  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.6 
 
 		 252 aa  138  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.0523288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2145  trehalose-6-phosphate phosphatase  36.17 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.55592e-22 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3792  trehalose-phosphatase  39.74 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299059  hitchhiker  0.000919174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  39.09 
 
 		 269 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  35.42 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1022  trehalose-6-phosphate phosphatase  37.5 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5910  HAD family hydrolase  40.37 
 
 		 265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3153  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.61 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  36.54 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4909  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.07 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379995  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42400  trehalose-phosphatase  34.98 
 
 		 253 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.43 
 
 		 249 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  37.45 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4210  HAD family hydrolase  42.27 
 
 		 245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4400  HAD family hydrolase  36.64 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4863  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.64 
 
 		 251 aa  126  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0256801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.77 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5493  HAD family hydrolase  38.79 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1019  HAD family hydrolase  37.44 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.07517  normal  0.48063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  34.55 
 
 		 248 aa  115  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0866  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2714  HAD family hydrolase  34.3 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2062  HAD family hydrolase  36.32 
 
 		 245 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20898  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0306  HAD family hydrolase  36.8 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3608  HAD family hydrolase  34.73 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1503  HAD family hydrolase  32.23 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3162  HAD family hydrolase  39.58 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.248638 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  36.21 
 
 		 253 aa  99  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  34.2 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  32.78 
 
 		 238 aa  95.5  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  34.45 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1803  HAD family hydrolase  32.04 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0790667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1771  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.165933 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0450  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  35.12 
 
 		 723 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0478  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  35.44 
 
 		 723 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0393601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0483  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  35.12 
 
 		 723 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.967333  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  34.01 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0799  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  29.7 
 
 		 733 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0650  trehalose-phosphatase  30.08 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1808  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.08 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2064  trehalose-phosphatase  31.8 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13408  trehalose 6-phosphate phosphatase otsB2  28.3 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3128  trehalose-phosphatase  27.73 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>