More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3022 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
400 aa  817  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  81.34 
 
 
402 aa  669  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  65 
 
 
403 aa  548  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  64.22 
 
 
405 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  64.22 
 
 
405 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  63.52 
 
 
403 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  63.28 
 
 
402 aa  538  1e-152  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  64.59 
 
 
401 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  64.65 
 
 
401 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  62.62 
 
 
406 aa  512  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  64.69 
 
 
402 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  62.09 
 
 
410 aa  491  1e-138  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  61.1 
 
 
417 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.93 
 
 
408 aa  466  1e-130  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.04 
 
 
406 aa  441  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  61.1 
 
 
379 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  52.59 
 
 
414 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  53.62 
 
 
414 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  51.6 
 
 
446 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  53.12 
 
 
407 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.01 
 
 
416 aa  358  1e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  50.13 
 
 
412 aa  355  7e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  45.9 
 
 
412 aa  321  1e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.11038e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  45.36 
 
 
434 aa  295  7e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  44.77 
 
 
426 aa  291  9e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  33.88 
 
 
409 aa  192  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  35.33 
 
 
372 aa  184  2e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  31.64 
 
 
451 aa  181  3e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  33.52 
 
 
369 aa  179  6e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  35.03 
 
 
370 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  33.41 
 
 
410 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  32.77 
 
 
369 aa  174  2e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.71 
 
 
453 aa  174  3e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  32.87 
 
 
369 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  35.62 
 
 
361 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  35.61 
 
 
414 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  34.63 
 
 
369 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  34.87 
 
 
406 aa  167  3e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.07 
 
 
412 aa  164  4e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.07 
 
 
412 aa  164  4e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  33.09 
 
 
420 aa  163  5e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.59 
 
 
415 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.98483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.68 
 
 
416 aa  158  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.75 
 
 
411 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.33 
 
 
417 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.42 
 
 
405 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  33.05 
 
 
417 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  30.9 
 
 
363 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  29.34 
 
 
457 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  32.76 
 
 
409 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  33.33 
 
 
359 aa  146  8e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  30.73 
 
 
461 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  30.46 
 
 
461 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  30.42 
 
 
408 aa  142  1e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18836e-05 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  34.82 
 
 
542 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.61 
 
 
400 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  31.4 
 
 
367 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.78626e-15  hitchhiker  6.08481e-12 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  29.19 
 
 
408 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  31.53 
 
 
407 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  31.55 
 
 
376 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.25 
 
 
409 aa  136  7e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  31.23 
 
 
431 aa  135  1e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.85 
 
 
465 aa  134  4e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  31.08 
 
 
425 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  31.35 
 
 
430 aa  132  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  33.99 
 
 
349 aa  132  1e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.64 
 
 
408 aa  132  1e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  32.84 
 
 
407 aa  131  2e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  30.37 
 
 
427 aa  130  5e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.64 
 
 
408 aa  129  8e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  5.59992e-07 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  29.64 
 
 
408 aa  129  1e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  30.09 
 
 
425 aa  129  1e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  31.45 
 
 
437 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.58 
 
 
501 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  28.69 
 
 
408 aa  126  8e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.75 
 
 
415 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  31.97 
 
 
440 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  29.24 
 
 
380 aa  123  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  31.62 
 
 
431 aa  122  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.86 
 
 
501 aa  122  1e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  31.47 
 
 
429 aa  122  1e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.92 
 
 
521 aa  122  1e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  30.38 
 
 
419 aa  121  2e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  30.38 
 
 
409 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  28.24 
 
 
428 aa  120  5e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  28.24 
 
 
428 aa  120  5e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  5.38057e-06 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.84 
 
 
509 aa  119  1e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  28.66 
 
 
338 aa  118  2e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  31.63 
 
 
414 aa  117  4e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  32.04 
 
 
406 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  29.39 
 
 
405 aa  115  1e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  30.87 
 
 
534 aa  115  1e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  32.04 
 
 
402 aa  115  1e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.69 
 
 
508 aa  115  2e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  26.03 
 
 
505 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  28.88 
 
 
425 aa  112  8e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  28.95 
 
 
419 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.45 
 
 
545 aa  112  1e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  27.89 
 
 
1016 aa  112  1e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.17 
 
 
418 aa  111  2e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>