233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3004 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1082 aa  2177    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  76.69 
 
 		 1087 aa  1631    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  38.39 
 
 		 1611 aa  378  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1241  TPR repeat-containing protein  24.96 
 
 		 1366 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0870262  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 817 aa  204  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.11 
 
 		 730 aa  180  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1123 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  27.75 
 
 		 1914 aa  140  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  22.22 
 
 		 732 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.94 
 
 		 2145 aa  129  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  25.24 
 
 		 1180 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  20.51 
 
 		 810 aa  115  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 		 878 aa  109  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0873  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 567 aa  108  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1714 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  20.31 
 
 		 1238 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 3172 aa  102  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1550 aa  100  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4338  hypothetical protein  34.55 
 
 		 711 aa  99  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.2 
 
 		 632 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3214  hypothetical protein  26.67 
 
 		 691 aa  94.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  27.98 
 
 		 1106 aa  94  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 		 771 aa  87.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  20.76 
 
 		 782 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 		 448 aa  87  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  22.36 
 
 		 694 aa  85.9  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2267  TPR repeat-containing protein  19.89 
 
 		 1519 aa  86.3  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  20.97 
 
 		 1911 aa  82.4  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 649 aa  81.6  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 		 639 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1674  hypothetical protein  29.71 
 
 		 754 aa  80.9  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204775  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  23.24 
 
 		 1288 aa  80.5  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  21.76 
 
 		 836 aa  80.1  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 924 aa  79.7  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.54 
 
 		 787 aa  79.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  28.53 
 
 		 1416 aa  79  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  22.55 
 
 		 665 aa  77.8  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 949 aa  77.4  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3533  hypothetical protein  23.81 
 
 		 338 aa  73.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.674186  normal  0.782695 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 1105 aa  74.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  19.03 
 
 		 887 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.28 
 
 		 1486 aa  72.4  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  23.67 
 
 		 708 aa  72  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.21 
 
 		 1424 aa  72.4  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  21.54 
 
 		 1526 aa  72.4  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 1119 aa  71.6  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4049  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.64 
 
 		 971 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  20.29 
 
 		 3301 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  25.88 
 
 		 686 aa  70.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.34 
 
 		 1186 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  20.8 
 
 		 733 aa  70.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 911 aa  69.7  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  22.63 
 
 		 1009 aa  68.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  20.38 
 
 		 676 aa  69.3  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  24.39 
 
 		 875 aa  68.9  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.74 
 
 		 2240 aa  68.9  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  23.1 
 
 		 828 aa  68.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 909 aa  67.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  21.79 
 
 		 566 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  19.35 
 
 		 1154 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  19.92 
 
 		 681 aa  67.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  20.5 
 
 		 486 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1186  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 		 1197 aa  66.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 681 aa  65.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  22.98 
 
 		 1131 aa  65.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 1028 aa  64.7  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0160  TPR repeat-containing protein  20.35 
 
 		 897 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  22.38 
 
 		 740 aa  63.9  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  19.66 
 
 		 3145 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  24.12 
 
 		 2327 aa  64.3  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  18.35 
 
 		 1313 aa  63.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  21.28 
 
 		 568 aa  62.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.19 
 
 		 816 aa  62.4  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.28 
 
 		 568 aa  62.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.09 
 
 		 1737 aa  62  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  20.29 
 
 		 2059 aa  62  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  24.4 
 
 		 799 aa  61.6  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  20.94 
 
 		 824 aa  61.2  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.62 
 
 		 689 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  23.26 
 
 		 724 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 		 448 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  21.5 
 
 		 1261 aa  60.1  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  23.97 
 
 		 1056 aa  59.7  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.6 
 
 		 885 aa  59.7  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  21.1 
 
 		 1215 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  22.65 
 
 		 714 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 2262 aa  58.9  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  23.22 
 
 		 953 aa  58.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 637 aa  58.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4349  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  21.7 
 
 		 1162 aa  58.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  23.48 
 
 		 807 aa  58.2  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 443 aa  57.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  22.16 
 
 		 576 aa  57.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  20.74 
 
 		 573 aa  57.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47724  predicted protein  26.15 
 
 		 646 aa  57.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642125  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.94 
 
 		 1162 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>