More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2973 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  70.81 
 
 
451 aa  650    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  75.93 
 
 
446 aa  674    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  75.41 
 
 
447 aa  667    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  72.66 
 
 
446 aa  652    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
448 aa  903    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  73.83 
 
 
446 aa  660    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  86.26 
 
 
450 aa  791    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  89.84 
 
 
450 aa  810    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  71.65 
 
 
449 aa  661    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  87.36 
 
 
450 aa  773    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  94.87 
 
 
448 aa  862    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  88.29 
 
 
449 aa  805    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  86.49 
 
 
450 aa  786    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  75.93 
 
 
446 aa  672    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  72.66 
 
 
446 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  74.43 
 
 
466 aa  682    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  67.5 
 
 
465 aa  625  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  65.84 
 
 
450 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  66.29 
 
 
450 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  66.44 
 
 
451 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  66.44 
 
 
448 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  65.03 
 
 
451 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  65.17 
 
 
450 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  65.7 
 
 
459 aa  605  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  65.03 
 
 
451 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  64.21 
 
 
445 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  64.94 
 
 
448 aa  572  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  64.79 
 
 
445 aa  570  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  61.57 
 
 
450 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  64.4 
 
 
456 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  61.49 
 
 
452 aa  551  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  61.07 
 
 
452 aa  546  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  62.59 
 
 
444 aa  541  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  58.92 
 
 
447 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  60 
 
 
447 aa  532  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  59.91 
 
 
447 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  61.21 
 
 
447 aa  527  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  57.43 
 
 
449 aa  514  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  58.8 
 
 
447 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  58.57 
 
 
447 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  59.91 
 
 
447 aa  503  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  55.53 
 
 
483 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  51.88 
 
 
454 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  51.22 
 
 
454 aa  458  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  51.79 
 
 
451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  51.66 
 
 
460 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  52.76 
 
 
450 aa  450  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  51.56 
 
 
451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  51.32 
 
 
469 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  51 
 
 
453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  53.15 
 
 
454 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  51.89 
 
 
452 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  51.81 
 
 
449 aa  441  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  52.45 
 
 
450 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  52.53 
 
 
450 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  51.69 
 
 
450 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  51.12 
 
 
496 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  51.12 
 
 
496 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  52.33 
 
 
450 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  50.99 
 
 
458 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  49.56 
 
 
446 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
450 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  51.16 
 
 
446 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 
446 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  50.93 
 
 
446 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 
450 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  49.67 
 
 
450 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 
450 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 
445 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  51.61 
 
 
455 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  51.61 
 
 
455 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1504  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 
446 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
450 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 
446 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  49.65 
 
 
447 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  50.12 
 
 
447 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1484  phosphoglucosamine mutase  51.04 
 
 
452 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  49.21 
 
 
444 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  52.51 
 
 
455 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1807  phosphoglucosamine mutase  48.17 
 
 
446 aa  412  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0573  phosphoglucosamine mutase  49.34 
 
 
467 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0791443  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  51.72 
 
 
446 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  50.81 
 
 
452 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0779  phosphoglucosamine mutase  50.81 
 
 
452 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  50.81 
 
 
452 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  48.86 
 
 
444 aa  412  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  49.56 
 
 
452 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  48.67 
 
 
447 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  48.32 
 
 
447 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1514  phosphoglucosamine mutase  50.81 
 
 
452 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 
451 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1290  phosphoglucosamine mutase  50.81 
 
 
452 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
450 aa  408  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  48.46 
 
 
451 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  49.2 
 
 
448 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
463 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2021  phosphoglucosamine mutase  51.39 
 
 
451 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 
447 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 
445 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4717  phosphoglucosamine mutase  49.33 
 
 
446 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>