More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2965 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  75.29 
 
 		 448 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  71.73 
 
 		 429 aa  651    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  73.66 
 
 		 431 aa  649    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  71.93 
 
 		 432 aa  657    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  75.52 
 
 		 430 aa  669    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 430 aa  877    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  72.96 
 
 		 431 aa  648    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  75.99 
 
 		 430 aa  670    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  71.73 
 
 		 533 aa  654    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  78.09 
 
 		 430 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  75.41 
 
 		 448 aa  687    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  84.88 
 
 		 430 aa  764    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  86.51 
 
 		 430 aa  779    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  86.98 
 
 		 430 aa  782    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  71.26 
 
 		 429 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  85.58 
 
 		 430 aa  774    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  96.51 
 
 		 457 aa  859    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  86.51 
 
 		 430 aa  771    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  71.69 
 
 		 432 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  78.32 
 
 		 430 aa  694    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  71.23 
 
 		 432 aa  659    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  69.7 
 
 		 430 aa  647    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  79.72 
 
 		 430 aa  711    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  71.93 
 
 		 432 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  72.16 
 
 		 432 aa  663    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  69.7 
 
 		 430 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  69.23 
 
 		 430 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  69.23 
 
 		 430 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  69.63 
 
 		 429 aa  623  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  66.82 
 
 		 430 aa  611  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0285  adenylosuccinate synthetase  67.76 
 
 		 429 aa  612  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0558  adenylosuccinate synthetase  66.05 
 
 		 429 aa  607  9.999999999999999e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  68.07 
 
 		 428 aa  600  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  67.06 
 
 		 429 aa  599  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  66.67 
 
 		 431 aa  598  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  67.13 
 
 		 431 aa  600  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  65.29 
 
 		 437 aa  591  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  64.49 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  64.72 
 
 		 429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0475  adenylosuccinate synthetase  66.67 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.636476  hitchhiker  0.00197029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  64.25 
 
 		 429 aa  559  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0337  adenylosuccinate synthetase  54.23 
 
 		 425 aa  502  1e-141  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112659  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0564  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 		 431 aa  485  1e-136  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6675  adenylosuccinate synthase  57.67 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5832  adenylosuccinate synthase  57.67 
 
 		 432 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6199  adenylosuccinate synthase  57.67 
 
 		 453 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0247215 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6526  adenylosuccinate synthetase  57.67 
 
 		 432 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5753  adenylosuccinate synthase  57.58 
 
 		 429 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.590489 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  53.7 
 
 		 442 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5997  adenylosuccinate synthase  57.58 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140056  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  54.55 
 
 		 432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5326  adenylosuccinate synthase  57.34 
 
 		 432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0668634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  51.97 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  51.97 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  52.09 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  53.13 
 
 		 431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  51.97 
 
 		 432 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 432 aa  450  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  54.1 
 
 		 431 aa  448  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  50.93 
 
 		 432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  51.63 
 
 		 431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  51.74 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  53.26 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  50.7 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  50.7 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  51.97 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  51.87 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  52.82 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  50.69 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  53.95 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  52.44 
 
 		 432 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  52.44 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  52.44 
 
 		 432 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  51.51 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  50.11 
 
 		 446 aa  441  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 430 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>