More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2839 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  100 
 
 
153 aa  322  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  100 
 
 
316 aa  306  9e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  100 
 
 
316 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  100 
 
 
316 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  100 
 
 
316 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  100 
 
 
316 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  100 
 
 
316 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  100 
 
 
316 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  100 
 
 
327 aa  305  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  100 
 
 
316 aa  304  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  77.85 
 
 
321 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  99.11 
 
 
329 aa  234  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  99.11 
 
 
329 aa  234  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  99.11 
 
 
329 aa  234  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  99.11 
 
 
286 aa  233  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  69.23 
 
 
319 aa  225  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  69.23 
 
 
319 aa  225  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  69.23 
 
 
319 aa  225  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  69.23 
 
 
319 aa  225  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  72.66 
 
 
277 aa  214  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  65 
 
 
320 aa  213  9.999999999999999e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  57.65 
 
 
463 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  59.28 
 
 
348 aa  196  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  59.28 
 
 
355 aa  196  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  59.28 
 
 
330 aa  196  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  59.28 
 
 
330 aa  195  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  59.04 
 
 
330 aa  194  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  59.04 
 
 
330 aa  194  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  59.04 
 
 
330 aa  193  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  67.65 
 
 
170 aa  192  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  59.31 
 
 
316 aa  174  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  59.31 
 
 
316 aa  174  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  59.31 
 
 
316 aa  174  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  59.31 
 
 
316 aa  174  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  59.03 
 
 
316 aa  172  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  59.03 
 
 
316 aa  172  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  55.48 
 
 
320 aa  169  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  58.4 
 
 
314 aa  168  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  53.38 
 
 
321 aa  168  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  54.96 
 
 
314 aa  161  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  53.38 
 
 
280 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  50.68 
 
 
216 aa  157  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  57.84 
 
 
284 aa  136  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  58.33 
 
 
259 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0443  integrase, catalytic region  71.43 
 
 
83 aa  123  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818125 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0252  transposase (class I)  76.81 
 
 
83 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  60 
 
 
265 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  56.44 
 
 
128 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  83.33 
 
 
303 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  56.79 
 
 
185 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5325  hypothetical protein  77.59 
 
 
197 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.969651  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1101  putative transposase  75 
 
 
53 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.32913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  35.62 
 
 
323 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  36.09 
 
 
463 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  36.09 
 
 
333 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  36.09 
 
 
321 aa  79  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  36.09 
 
 
321 aa  79  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  39.26 
 
 
329 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  34.67 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  35.04 
 
 
325 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  32.19 
 
 
238 aa  70.9  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  34.01 
 
 
323 aa  70.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  34.92 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  34.13 
 
 
323 aa  67.4  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  35.51 
 
 
497 aa  67  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  30.41 
 
 
325 aa  67  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  35.51 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  32.61 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  31.85 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  35.51 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  35.51 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  31.85 
 
 
329 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  31.85 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  31.85 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0527  Integrase catalytic region  31.4 
 
 
349 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  34.43 
 
 
607 aa  60.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  30.08 
 
 
338 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  30.38 
 
 
229 aa  58.9  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  32.99 
 
 
597 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3186  integrase catalytic subunit  41.24 
 
 
348 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3733  integrase catalytic subunit  41.24 
 
 
348 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3191  integrase catalytic subunit  41.24 
 
 
348 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2262  integrase catalytic subunit  41.24 
 
 
348 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.512462  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1864  integrase catalytic subunit  41.24 
 
 
348 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  31.78 
 
 
273 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1966  ISSod13, transposase  40.21 
 
 
291 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  31.78 
 
 
273 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  31.78 
 
 
273 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  31.78 
 
 
273 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  31.78 
 
 
273 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  32.08 
 
 
349 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2762  Integrase catalytic region  29.53 
 
 
381 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  30.43 
 
 
330 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1393  Integrase catalytic region  25.37 
 
 
374 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000348935  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0044  Integrase catalytic region  25.37 
 
 
375 aa  54.7  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337574  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  30.94 
 
 
343 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  29.91 
 
 
316 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  30.94 
 
 
332 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  29.91 
 
 
316 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  29.91 
 
 
316 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>