294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2812 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2812  heat shock protein 90  100 
 
 
637 aa  1276    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5302  heat shock protein 90  51.42 
 
 
628 aa  641    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4673  heat shock protein 90  64.48 
 
 
631 aa  837    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25549  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4692  heat shock protein 90  53.02 
 
 
628 aa  653    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595162  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3632  heat shock protein 90  86.83 
 
 
638 aa  1126    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1910  heat shock protein 90  53.6 
 
 
650 aa  706    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194345 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4272  heat shock protein 90  62.56 
 
 
643 aa  818    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0826  heat shock protein 90  55.44 
 
 
657 aa  737    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5351  heat shock protein 90  63.96 
 
 
630 aa  814    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.514382 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6025  heat shock protein 90  60.49 
 
 
630 aa  767    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1326  heat shock protein 90  51.99 
 
 
624 aa  628  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4402  heat shock protein 90  51.74 
 
 
628 aa  628  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626215  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4929  heat shock protein 90  51.9 
 
 
620 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.621243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  50.87 
 
 
626 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  47.32 
 
 
610 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0452  heat shock protein 90  48.3 
 
 
629 aa  549  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0853  heat shock protein 90  42.54 
 
 
637 aa  542  1e-153  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.773186  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  46.89 
 
 
611 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1028  heat shock protein 90  47.95 
 
 
626 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162426  normal  0.169491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0960  heat shock protein 90  47.37 
 
 
626 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.515332  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  47.26 
 
 
611 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1155  heat shock protein 90  46.69 
 
 
626 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0237  heat shock protein 90  42.65 
 
 
637 aa  531  1e-149  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.528413  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  44.73 
 
 
633 aa  520  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  44.23 
 
 
626 aa  521  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1277  heat shock protein 90  40.93 
 
 
635 aa  505  9.999999999999999e-143  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  42.72 
 
 
636 aa  506  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  41.61 
 
 
628 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  41.61 
 
 
628 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  42.79 
 
 
652 aa  504  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  42.9 
 
 
647 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3087  heat shock protein 90  45.45 
 
 
606 aa  501  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  42.93 
 
 
634 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2480  heat shock protein 90  40.44 
 
 
640 aa  496  1e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  42.83 
 
 
628 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  42.77 
 
 
634 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  42.45 
 
 
634 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  41.81 
 
 
634 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  42.45 
 
 
634 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0495  heat shock protein 90  40.42 
 
 
620 aa  489  1e-137  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  43.46 
 
 
643 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  42.74 
 
 
633 aa  491  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1548  heat shock protein 90  43.2 
 
 
630 aa  492  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00180815  normal  0.134338 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0990  heat shock protein 90  43.3 
 
 
640 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0890084  normal  0.343937 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  43.77 
 
 
643 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  43.42 
 
 
632 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  44.37 
 
 
632 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  42.34 
 
 
632 aa  488  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  42.43 
 
 
634 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  42.06 
 
 
629 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  42.54 
 
 
634 aa  482  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  42.06 
 
 
629 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  41.9 
 
 
635 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  42.06 
 
 
637 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  43.86 
 
 
632 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  43.11 
 
 
630 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  44.06 
 
 
634 aa  485  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  43.23 
 
 
640 aa  485  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  43.26 
 
 
632 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  41.41 
 
 
650 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  41.93 
 
 
634 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  43.7 
 
 
632 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  42.13 
 
 
634 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0266  heat shock protein 90  41.12 
 
 
636 aa  480  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.48191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  43.7 
 
 
632 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  43.7 
 
 
632 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  43.11 
 
 
632 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  41.49 
 
 
634 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  43.54 
 
 
632 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  39.34 
 
 
635 aa  482  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  43.54 
 
 
632 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19170  heat shock protein 90  41.9 
 
 
635 aa  482  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000174366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  40.09 
 
 
645 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  43.7 
 
 
632 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  43.7 
 
 
632 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00313  heat shock protein 90  42.03 
 
 
634 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  41.51 
 
 
622 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1175  heat shock protein 90  40.97 
 
 
650 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  39.72 
 
 
630 aa  476  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  42.95 
 
 
632 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  41.51 
 
 
624 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  42.79 
 
 
632 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0296  heat shock protein 90  40.97 
 
 
636 aa  478  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  41.51 
 
 
624 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  42.79 
 
 
632 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2370  heat shock protein 90  39.97 
 
 
642 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0508031  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1997  heat shock protein 90  40.16 
 
 
619 aa  474  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2506  heat shock protein 90  42.74 
 
 
633 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595688  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  42.33 
 
 
623 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  39.65 
 
 
623 aa  474  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  39.81 
 
 
644 aa  475  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  40.51 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  40.51 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  40.35 
 
 
624 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  40.35 
 
 
624 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  40.35 
 
 
624 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  40 
 
 
639 aa  472  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  40.51 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  40.28 
 
 
630 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  40.51 
 
 
624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>