More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2728 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  100 
 
 
456 aa  907    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  91.41 
 
 
454 aa  828    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  62.69 
 
 
456 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  63.3 
 
 
456 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  62.78 
 
 
456 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  62.72 
 
 
465 aa  567  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  62.72 
 
 
465 aa  567  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  62.42 
 
 
454 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  62.28 
 
 
461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  61.31 
 
 
457 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  61.31 
 
 
457 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  62.84 
 
 
455 aa  547  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  61.57 
 
 
456 aa  536  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  57.86 
 
 
458 aa  533  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1398  magnesium transport protein  60.19 
 
 
458 aa  507  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  44.42 
 
 
460 aa  362  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  43.86 
 
 
458 aa  361  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  48.58 
 
 
441 aa  359  7e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  48.58 
 
 
441 aa  359  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  48.58 
 
 
441 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  45.9 
 
 
463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  42.79 
 
 
460 aa  347  3e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  42.33 
 
 
460 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  43.26 
 
 
460 aa  335  9e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  42.92 
 
 
460 aa  331  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  48.92 
 
 
438 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  42.69 
 
 
460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  44.52 
 
 
460 aa  323  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  43.76 
 
 
458 aa  323  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  41.3 
 
 
463 aa  322  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  42.36 
 
 
460 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  36.26 
 
 
454 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  32.39 
 
 
444 aa  252  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  32.66 
 
 
449 aa  248  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  32.08 
 
 
452 aa  240  4e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  31.49 
 
 
456 aa  239  5e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  35.2 
 
 
445 aa  239  8e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  31.36 
 
 
446 aa  239  9e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  34.91 
 
 
447 aa  237  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  35.53 
 
 
451 aa  236  5.0000000000000005e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  35.71 
 
 
450 aa  236  9e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  30.25 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  35.6 
 
 
466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  34.68 
 
 
449 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30070  Mg2+ transporter MgtE  32.71 
 
 
461 aa  233  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  35.15 
 
 
453 aa  233  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  31.58 
 
 
442 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  34.25 
 
 
463 aa  230  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  31.42 
 
 
447 aa  230  4e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  33.66 
 
 
468 aa  229  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  31.82 
 
 
446 aa  228  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  33.17 
 
 
452 aa  228  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  36.34 
 
 
462 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  36.34 
 
 
462 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  35.29 
 
 
463 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  34.88 
 
 
454 aa  227  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  34.86 
 
 
447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  34.44 
 
 
449 aa  226  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  36.75 
 
 
447 aa  226  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  33.86 
 
 
450 aa  225  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  35.06 
 
 
465 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  32.7 
 
 
447 aa  224  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0507  hypothetical protein  30 
 
 
463 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.593937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  38.48 
 
 
351 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  32.79 
 
 
454 aa  220  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  31.28 
 
 
451 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  33.72 
 
 
473 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  33.25 
 
 
461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  33.25 
 
 
461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  31.7 
 
 
452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10367  Mg2+ transport transmembrane protein mgtE  36.54 
 
 
460 aa  216  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.54721 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  31.21 
 
 
449 aa  215  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  33.33 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  30.59 
 
 
458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  27.79 
 
 
454 aa  213  7e-54  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  32.47 
 
 
457 aa  212  9e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  31.4 
 
 
457 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  36.6 
 
 
469 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  30.37 
 
 
442 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  32.65 
 
 
461 aa  210  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  30.73 
 
 
457 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  37.04 
 
 
454 aa  209  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  31.4 
 
 
457 aa  209  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  34.29 
 
 
447 aa  209  9e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  32.73 
 
 
457 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  33.78 
 
 
454 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  32.99 
 
 
457 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  33.7 
 
 
469 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  32.99 
 
 
457 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0051  magnesium transporter  34.98 
 
 
458 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.242688 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  33.11 
 
 
469 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  36.36 
 
 
468 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  29.8 
 
 
455 aa  207  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  33.02 
 
 
449 aa  206  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  30.34 
 
 
473 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  33.57 
 
 
444 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  31.14 
 
 
471 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04510  Mg2+ transporter MgtE  32.29 
 
 
450 aa  204  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  36.22 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  35.53 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>