More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2663 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 202 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  52.91 
 
 		 203 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  53.3 
 
 		 208 aa  215  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  49.74 
 
 		 203 aa  210  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  50.79 
 
 		 208 aa  207  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  50.54 
 
 		 192 aa  206  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  50.27 
 
 		 192 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  48.95 
 
 		 203 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 203 aa  204  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  48.42 
 
 		 203 aa  203  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  48.94 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  46.23 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  50.76 
 
 		 203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  51.67 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 194 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  50.55 
 
 		 194 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  42.36 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  35.45 
 
 		 180 aa  91.7  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  35.26 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9030  hypothetical protein  41.49 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 237 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  28.43 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  31.15 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  25.53 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  36.13 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  28.44 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  25.42 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  36.56 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  36.56 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  38.75 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  32.3 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  35.05 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  34.29 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  26.56 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  26.52 
 
 		 240 aa  62  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  37.74 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  37.74 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  23.63 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  37.74 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  38.71 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  38.75 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  27.62 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  38 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  30.84 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  34.88 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  31.14 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  26.61 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  26.87 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  36.47 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  28.34 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  30.61 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  42.47 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  28.97 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  38.71 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0292  isochorismatase family protein  27.71 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  29.37 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  27.8 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  38.1 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  33.67 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  27.46 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  38.1 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  37.25 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  29.59 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  28.43 
 
 		 389 aa  55.5  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  31.91 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  35.44 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  27.27 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  27.06 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1215  isochorismatase family protein  34.12 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00883088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  27.06 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  34.41 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>