23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2640 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2640  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  174  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3268  hypothetical protein  90.59 
 
 
85 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3667  hypothetical protein  68.24 
 
 
85 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6299  hypothetical protein  61.18 
 
 
85 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4150  hypothetical protein  60 
 
 
85 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3472  hypothetical protein  57.65 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1895  hypothetical protein  57.65 
 
 
85 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0671  hypothetical protein  57.65 
 
 
85 aa  103  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4563  hypothetical protein  56.47 
 
 
85 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271369  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0882  hypothetical protein  59.49 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0921  hypothetical protein  59.49 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00987633  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0857  hypothetical protein  59.46 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3052  hypothetical protein  49.41 
 
 
85 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0400386  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0304  hypothetical protein  36 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2301  hypothetical protein  33.33 
 
 
80 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662209  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0062  hypothetical protein  37.97 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0785  hypothetical protein  34.18 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325049  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0076  hypothetical protein  33.75 
 
 
86 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3387  hypothetical protein  35.44 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5763  hypothetical protein  33.78 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4442  hypothetical protein  34.85 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.128261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0850  hypothetical protein  37.65 
 
 
86 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176173  decreased coverage  0.000187412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0954  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>