More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2626 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  100 
 
 
337 aa  666    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  92.17 
 
 
346 aa  621  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  90.61 
 
 
332 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  90.24 
 
 
334 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  89.63 
 
 
332 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  88.13 
 
 
334 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  88.13 
 
 
334 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  78.15 
 
 
333 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  71.6 
 
 
333 aa  481  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  71.69 
 
 
333 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  71.08 
 
 
336 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  68.15 
 
 
336 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.15 
 
 
336 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  71.2 
 
 
342 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  71.78 
 
 
336 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  69.54 
 
 
336 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  71.03 
 
 
349 aa  455  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.04 
 
 
336 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.67 
 
 
336 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  69.94 
 
 
335 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  69.3 
 
 
335 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  69.62 
 
 
335 aa  448  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  71.57 
 
 
337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  68.34 
 
 
340 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  68.83 
 
 
334 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  64.9 
 
 
336 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  66.11 
 
 
343 aa  424  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  61.18 
 
 
332 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  61.56 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.8 
 
 
350 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  61.56 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  60.94 
 
 
338 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  60.37 
 
 
335 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  60.94 
 
 
335 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  60.8 
 
 
333 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  61.81 
 
 
362 aa  371  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2767  ATPase  63.61 
 
 
335 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.26 
 
 
320 aa  323  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  49.22 
 
 
317 aa  318  6e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.49 
 
 
308 aa  318  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  50.63 
 
 
321 aa  315  5e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.9 
 
 
320 aa  314  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  47.34 
 
 
317 aa  312  5.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.4 
 
 
327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.15 
 
 
379 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.45 
 
 
351 aa  303  4.0000000000000003e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.64 
 
 
334 aa  300  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  48.4 
 
 
356 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.81 
 
 
338 aa  288  7e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.78 
 
 
349 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.91 
 
 
327 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  47.87 
 
 
338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.85 
 
 
334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.34 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  46.42 
 
 
343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  46.91 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  46.98 
 
 
334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.02 
 
 
341 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.39 
 
 
345 aa  278  8e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.1 
 
 
333 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.27 
 
 
334 aa  276  4e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.03 
 
 
341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.02 
 
 
356 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  46.71 
 
 
324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  44.51 
 
 
324 aa  271  9e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  44.84 
 
 
324 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.93 
 
 
325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  42.86 
 
 
329 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  44.84 
 
 
318 aa  266  4e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.93 
 
 
313 aa  266  5e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.67 
 
 
333 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.38 
 
 
325 aa  259  7e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  41.35 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  43.87 
 
 
320 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  45.07 
 
 
345 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  45.89 
 
 
314 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.06 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  44.9 
 
 
333 aa  242  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  44.9 
 
 
333 aa  242  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  42.81 
 
 
330 aa  241  9e-63  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.98 
 
 
341 aa  241  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.31 
 
 
318 aa  240  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  40.26 
 
 
315 aa  240  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  44.59 
 
 
333 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  43.04 
 
 
339 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  43.65 
 
 
337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.44 
 
 
324 aa  239  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  43.04 
 
 
344 aa  238  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  40.06 
 
 
328 aa  237  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  40.41 
 
 
346 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  42.47 
 
 
326 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  42.47 
 
 
326 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.55 
 
 
327 aa  235  7e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  45.12 
 
 
347 aa  235  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.33 
 
 
432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  39.31 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1215  ATPase  41.56 
 
 
340 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  43.55 
 
 
325 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  37.16 
 
 
328 aa  233  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.63 
 
 
310 aa  233  3e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>