More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2543 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
165 aa  321  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  84.24 
 
 
164 aa  257  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  74.55 
 
 
165 aa  246  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  73.94 
 
 
165 aa  243  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  70.3 
 
 
164 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1394  lipoprotein signal peptidase  71.33 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.660722  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1715  lipoprotein signal peptidase  65.45 
 
 
165 aa  168  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.488769  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  47.2 
 
 
167 aa  144  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  48.47 
 
 
171 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  49.38 
 
 
171 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  48.77 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  47.22 
 
 
184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  52.03 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
171 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 
171 aa  120  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  48.65 
 
 
165 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 
177 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  42.24 
 
 
154 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 
199 aa  99.4  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  45 
 
 
160 aa  98.2  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2206  lipoprotein signal peptidase  49.21 
 
 
177 aa  97.1  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.252335  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  42.41 
 
 
174 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  37.42 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  38.65 
 
 
169 aa  88.6  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 
173 aa  87.4  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 
158 aa  87  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 
178 aa  85.1  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  38.93 
 
 
165 aa  84.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 
169 aa  84  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  40 
 
 
123 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  39.68 
 
 
227 aa  80.9  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  32.89 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  33.54 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  36.71 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  36.71 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  31.37 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  40.16 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  35.22 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3258  signal peptidase II  40 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802617  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  30.52 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  30.97 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 
176 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 
174 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 
178 aa  72  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  37.4 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0092  lipoprotein signal peptidase  32.85 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142417  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  40.27 
 
 
364 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4043  signal peptidase II  36.03 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  30.06 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>