186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2527 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  85.92 
 
 		 206 aa  348  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  73.02 
 
 		 206 aa  284  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  69.27 
 
 		 207 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  67.72 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  67.72 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  67.42 
 
 		 207 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  45.19 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  43.65 
 
 		 236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  40.58 
 
 		 452 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  36.84 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  37.65 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  39.3 
 
 		 447 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  38.78 
 
 		 449 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  33.85 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  38.81 
 
 		 449 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  38.82 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  32.17 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  40 
 
 		 453 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  36.44 
 
 		 254 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  36.36 
 
 		 454 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  36.51 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  36.32 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  36.51 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  33.02 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  36.46 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  34.93 
 
 		 225 aa  99  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  35.91 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  36.41 
 
 		 255 aa  98.6  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  32.49 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  32.63 
 
 		 229 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  40.56 
 
 		 212 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  32 
 
 		 236 aa  95.1  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  34.34 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  36.15 
 
 		 250 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  32.66 
 
 		 283 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  35.65 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  36.49 
 
 		 258 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  40.14 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  32.46 
 
 		 274 aa  92  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  32.46 
 
 		 274 aa  92  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  30.77 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  33.49 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  33.03 
 
 		 255 aa  91.7  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  30.67 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  33.33 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  34.66 
 
 		 277 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  30.67 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  28.97 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  35.12 
 
 		 246 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  34.67 
 
 		 237 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  33.67 
 
 		 234 aa  89  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  33.49 
 
 		 212 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  32.91 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  32.99 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  33.94 
 
 		 279 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  37.5 
 
 		 274 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  35.87 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  35.81 
 
 		 251 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  37.66 
 
 		 710 aa  84.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1247  hypothetical protein  30.41 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  31.82 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  30.58 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  31.73 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  33.14 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_004310  BR1284  hypothetical protein  29.9 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  32.9 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  34.19 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  34.5 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  32.6 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  32.62 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.04 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  30.17 
 
 		 693 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  33.76 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  30.3 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  31.4 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  37.11 
 
 		 245 aa  78.2  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  30.77 
 
 		 566 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  35.05 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  32.33 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  27.73 
 
 		 680 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  30.74 
 
 		 279 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  30.45 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  31.35 
 
 		 652 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  35.2 
 
 		 661 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  32.62 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  35.2 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  32.76 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  33.74 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  33.16 
 
 		 662 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  34.13 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  29.23 
 
 		 570 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  32.5 
 
 		 287 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  33.33 
 
 		 245 aa  72  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  32.03 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  32.38 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  33.73 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  31.58 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  31.58 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  32.67 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>