150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2519 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  336  8e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  89.82 
 
 		 182 aa  297  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  77.44 
 
 		 186 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  77.71 
 
 		 185 aa  244  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  79.47 
 
 		 169 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  81.38 
 
 		 183 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  69.41 
 
 		 185 aa  227  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  62.22 
 
 		 226 aa  174  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  60.71 
 
 		 191 aa  171  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  55.92 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  60.71 
 
 		 191 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  61.7 
 
 		 187 aa  170  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  57.42 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  57.42 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 174 aa  160  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  55.03 
 
 		 179 aa  157  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 237 aa  156  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 173 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  56.15 
 
 		 154 aa  150  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 168 aa  117  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  46.6 
 
 		 167 aa  97.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  46.6 
 
 		 167 aa  97.4  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 158 aa  90.9  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  36.11 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  37.37 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 146 aa  87.8  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 160 aa  87.4  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 157 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  39.62 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  27.68 
 
 		 148 aa  50.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  26.27 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  26.5 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 323 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  27.35 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  27.35 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  23.4 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  27.35 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  26.5 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  26.5 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  26.5 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  26.5 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  27.35 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  27.35 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  26.5 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  26.5 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  26.5 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 169 aa  47.4  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  23.66 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0413  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.019986  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 140 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  26.32 
 
 		 146 aa  44.3  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>