176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2508 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2508  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
153 aa  311  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.184666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3099  MaoC-like dehydratase  84.97 
 
 
153 aa  273  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1771  hypothetical protein  73.97 
 
 
153 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3997  MaoC-like dehydratase  68.28 
 
 
155 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4157  MaoC-like dehydratase  68.28 
 
 
156 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.967717  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4836  MaoC domain protein dehydratase  64.24 
 
 
160 aa  207  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1419  MaoC-like dehydratase  68.87 
 
 
151 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.982529  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2254  dehydratase  51.41 
 
 
158 aa  159  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437437  normal  0.402982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2601  dehydratase  50 
 
 
154 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.801484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0169  dehydratase  44.14 
 
 
334 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0997526  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3196  hypothetical protein  46.98 
 
 
156 aa  134  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2160  MaoC-like dehydratase  44.59 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2195  MaoC domain protein dehydratase  40.85 
 
 
161 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.300893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1872  MaoC domain protein dehydratase  40.14 
 
 
161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1628  dehydratase  44.37 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.584563  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2268  dehydratase  44.14 
 
 
151 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.276096  normal  0.630961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4342  MaoC domain protein dehydratase  48.34 
 
 
180 aa  127  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482582 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3698  MaoC-related protein  43.66 
 
 
155 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27276  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2773  MaoC domain protein dehydratase  45.89 
 
 
154 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377896  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3037  MaoC domain protein dehydratase  43.45 
 
 
163 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667967  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1390  dehydratase  44.67 
 
 
150 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2414  MaoC domain protein dehydratase  40.67 
 
 
332 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1538  maoC-related protein  42.96 
 
 
166 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0790227  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2043  hypothetical protein  38.73 
 
 
156 aa  120  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.770796  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2815  MaoC domain protein dehydratase  42.96 
 
 
334 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846625  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1487  maoC-related protein  43.66 
 
 
166 aa  120  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2125  MaoC-like dehydratase  42.66 
 
 
152 aa  120  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.133316  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1473  dehydratase  43.85 
 
 
172 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3190  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  39.73 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2320  MaoC domain protein dehydratase  40.14 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0980  MaoC-like dehydratase  40 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1810  MoaC domain-containing protein  34.9 
 
 
152 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0727  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1149  MoaC domain-containing protein  34.9 
 
 
152 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.58838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0718  MoaC domain-containing protein  34.9 
 
 
152 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0432  MoaC domain-containing protein  34.9 
 
 
152 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1455  MoaC domain-containing protein  34.9 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1080  MoaC domain-containing protein  35.57 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2709  MaoC domain protein dehydratase  38 
 
 
332 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1364  MaoC domain protein dehydratase  40 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362364  hitchhiker  0.00124246 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1309  MoaC domain-containing protein  34.9 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1318  MoaC domain-containing protein  34.9 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233645  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2486  dehydratase  38 
 
 
352 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0349  MaoC domain protein dehydratase  40.14 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2396  dehydratase  41.98 
 
 
334 aa  114  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0902471  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4123  dehydratase  41.1 
 
 
329 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5558  MaoC-like dehydratase  35.62 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0946  MaoC-like dehydratase  36.11 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0047  dehydratase  39.47 
 
 
157 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2796  MaoC domain protein dehydratase  35.86 
 
 
145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2490  MaoC domain protein dehydratase  39.19 
 
 
148 aa  107  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2268  dehydratase  35.1 
 
 
153 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0096  MaoC domain protein dehydratase  38.1 
 
 
147 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2147  dehydratase  34.44 
 
 
153 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159813  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1047  dehydratase  34.25 
 
 
153 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0118845  normal  0.124515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1990  dehydratase  34.93 
 
 
152 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  normal  0.551066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1618  MaoC-like dehydratase  34.03 
 
 
167 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2230  dehydratase  34.03 
 
 
167 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2254  dehydratase  33.56 
 
 
153 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3664  dehydratase  37.33 
 
 
151 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0225  MaoC-like dehydratase  39.57 
 
 
151 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369748  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3961  MaoC domain protein dehydratase  39.32 
 
 
120 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5482  dehydratase  39.73 
 
 
147 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3543  MaoC-like dehydratase  37.5 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.925592  normal  0.245974 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1835  MaoC domain protein dehydratase  40.65 
 
 
133 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0897261  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0849  MaoC-like dehydratase  35.17 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2976  dehydratase  36.55 
 
 
158 aa  97.1  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2194  MaoC-like dehydratase  38.36 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3209  MaoC domain protein dehydratase  35.1 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0647415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0047  MaoC domain protein dehydratase  35.42 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3098  MaoC-like dehydratase  34.62 
 
 
160 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1191  MaoC-like dehydratase  35.71 
 
 
149 aa  94  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4680  dehydratase  33.33 
 
 
153 aa  93.6  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314725  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3197  hypothetical protein  34.69 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3996  MaoC-like dehydratase  32.9 
 
 
160 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0620  MaoC-like dehydratase  33.58 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05499  hypothetical protein  34.48 
 
 
165 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3454  MaoC domain protein dehydratase  37.24 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0800  MaoC domain-containing protein dehydratase  41.38 
 
 
161 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4835  MaoC domain protein dehydratase  32.68 
 
 
160 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4156  MaoC-like dehydratase  32.03 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.717491  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3813  MaoC domain protein dehydratase  31.69 
 
 
152 aa  85.5  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2600  dehydratase  29.22 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2507  MaoC-like dehydratase  31.45 
 
 
161 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18160  hypothetical protein  32.68 
 
 
161 aa  84  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2253  dehydratase  32.7 
 
 
160 aa  84  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350029  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2161  MaoC-like dehydratase  32.64 
 
 
154 aa  83.6  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1772  hypothetical protein  30.72 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4164  MaoC domain protein dehydratase  34.62 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0495  dehydratase  30.56 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1539  maoC-related protein  30.07 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.250749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1420  MaoC-like dehydratase  30.52 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.788165  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1662  dehydratase  31.97 
 
 
146 aa  79  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2522  MaoC domain-containing protein  26.71 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0109076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0028  dehydratase  26.71 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1809  dehydratase  30.3 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0834383  normal  0.792889 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0028  dehydratase  26.71 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2774  MaoC domain protein dehydratase  28.38 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.664287  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1627  dehydratase  28.76 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2269  dehydratase  30.07 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265677  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3038  MaoC domain protein dehydratase  27.7 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.724485  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>