More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2455 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
226 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  95.58 
 
 
226 aa  441  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  84.07 
 
 
224 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.3 
 
 
226 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.3 
 
 
226 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.3 
 
 
226 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  80.97 
 
 
225 aa  377  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.39 
 
 
215 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.85 
 
 
216 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.31 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.34 
 
 
211 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  38.54 
 
 
267 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  34.08 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.72 
 
 
241 aa  111  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.55 
 
 
220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  34.6 
 
 
249 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.65 
 
 
232 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  32.39 
 
 
309 aa  105  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.48 
 
 
215 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  33.98 
 
 
223 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  32.85 
 
 
250 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.92 
 
 
215 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.28 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.36 
 
 
219 aa  96.3  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.28 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.28 
 
 
229 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.53 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.99 
 
 
212 aa  91.7  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.1 
 
 
221 aa  89  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  32.67 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.29 
 
 
209 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.37 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.05 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.58 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  31.19 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  33.89 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  29.17 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.13 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.95 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.73 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.9 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.62 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.67 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.72 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  29.76 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.4 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.12 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.28 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5587  hypothetical protein  27.32 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.895248  normal  0.0278536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.1 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  34.44 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.13 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  26.16 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  33.33 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  26.61 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  32.04 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 
217 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  28.57 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.06 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.47 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.06 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.93 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  27.32 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0129  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.06 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.58 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.53 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.83 
 
 
268 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  32.14 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  31.58 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.91 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.06 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  31.1 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  25.21 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.24 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.07 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.78 
 
 
192 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  30.82 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2389  putative partition-related protein  37.01 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.9 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.15 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>