267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2350 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  100 
 
 
178 aa  353  8.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  82.02 
 
 
178 aa  295  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  65.27 
 
 
170 aa  227  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  66.03 
 
 
180 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  60.59 
 
 
179 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  58.08 
 
 
179 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3263  dihydrofolate reductase  60.84 
 
 
171 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.254952  normal  0.239963 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  52.66 
 
 
172 aa  176  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  52.07 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  50.29 
 
 
166 aa  166  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  52.1 
 
 
187 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  52.15 
 
 
167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 
171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  51.18 
 
 
169 aa  162  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  44.12 
 
 
171 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  46.43 
 
 
174 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  49.39 
 
 
167 aa  156  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  48.78 
 
 
167 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  49.4 
 
 
164 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  48.78 
 
 
167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  47.43 
 
 
167 aa  153  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  51.79 
 
 
162 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
166 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  47.31 
 
 
166 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  51.19 
 
 
173 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  47.02 
 
 
178 aa  148  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 
169 aa  148  5e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
166 aa  147  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
166 aa  147  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  43.21 
 
 
170 aa  147  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  46.91 
 
 
171 aa  147  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  47.02 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  46.11 
 
 
166 aa  145  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  48.21 
 
 
163 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  46.11 
 
 
166 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  46.55 
 
 
166 aa  144  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  48.47 
 
 
177 aa  144  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  43.64 
 
 
163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  44.24 
 
 
166 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  49.4 
 
 
292 aa  144  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  46.11 
 
 
195 aa  144  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  45.56 
 
 
173 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  46.43 
 
 
165 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  39.43 
 
 
183 aa  143  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  45.06 
 
 
170 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  42.11 
 
 
183 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  42.33 
 
 
172 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 
166 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 
164 aa  141  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 
176 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  42.33 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 
167 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
171 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  48.23 
 
 
160 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1729  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 
198 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000733059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 
161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  50.71 
 
 
160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  47.34 
 
 
165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  43.37 
 
 
167 aa  137  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 
170 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  44.24 
 
 
163 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0603  Dihydrofolate reductase  45.06 
 
 
174 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.052544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 
167 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 
167 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 
167 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 
167 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 
160 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  43.21 
 
 
169 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 
167 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 
167 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 
167 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 
167 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  44.05 
 
 
166 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  36.81 
 
 
162 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  45.68 
 
 
162 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  38.18 
 
 
160 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  38.41 
 
 
160 aa  134  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  39.76 
 
 
160 aa  135  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  36.97 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  45.39 
 
 
160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  40.36 
 
 
160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  44.97 
 
 
164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  45.61 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
166 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  43.45 
 
 
161 aa  134  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  40.48 
 
 
160 aa  134  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  36.36 
 
 
162 aa  134  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  36.97 
 
 
162 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  40.36 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  43.21 
 
 
170 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  46.43 
 
 
164 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>