More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2288 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  75.18 
 
 		 424 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  100 
 
 		 424 aa  866    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  75.31 
 
 		 417 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  83.45 
 
 		 424 aa  738    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  70.14 
 
 		 422 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  71.77 
 
 		 420 aa  627  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  71.53 
 
 		 420 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  63.11 
 
 		 418 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  60.96 
 
 		 408 aa  534  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  63.29 
 
 		 420 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  62.26 
 
 		 420 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  62.26 
 
 		 420 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  58.84 
 
 		 414 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  50 
 
 		 406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  49.88 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  52.11 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  49.28 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  51.82 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  49.15 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  49.15 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  49.27 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  50.36 
 
 		 406 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  48.56 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  47.51 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  43.37 
 
 		 417 aa  323  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  39.04 
 
 		 419 aa  300  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  41.33 
 
 		 411 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  40.33 
 
 		 411 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  39.48 
 
 		 412 aa  276  6e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  40.1 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  40.86 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  39.18 
 
 		 438 aa  270  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  38.59 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  40.67 
 
 		 407 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  40.8 
 
 		 407 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  40.33 
 
 		 418 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  37.84 
 
 		 440 aa  259  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  37.86 
 
 		 426 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  39.62 
 
 		 407 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  38.98 
 
 		 411 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  38.23 
 
 		 415 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  39.14 
 
 		 402 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  37.94 
 
 		 447 aa  249  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  39.28 
 
 		 409 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  35.55 
 
 		 423 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  35.7 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  37.59 
 
 		 454 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  35.02 
 
 		 399 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  38.12 
 
 		 427 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  35.48 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  39.53 
 
 		 453 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  37.53 
 
 		 613 aa  227  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  35.73 
 
 		 452 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  35.63 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  35.71 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  34.58 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  35.07 
 
 		 430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  33.26 
 
 		 438 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  34.92 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  34.92 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  35.01 
 
 		 401 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  32.71 
 
 		 468 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  34.28 
 
 		 431 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  33.89 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  36.03 
 
 		 414 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  31.71 
 
 		 382 aa  204  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  33.02 
 
 		 427 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  33.57 
 
 		 426 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  35.6 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  34.12 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  35.19 
 
 		 401 aa  195  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  37.2 
 
 		 440 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  33.66 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  33.16 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  32.9 
 
 		 395 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  31.08 
 
 		 432 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  31.83 
 
 		 444 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  37.01 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  34.06 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  32.41 
 
 		 416 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  33.98 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  32.13 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  34.69 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  30.54 
 
 		 431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  31.5 
 
 		 409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  33.17 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  33.02 
 
 		 431 aa  176  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  30.29 
 
 		 437 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  34.43 
 
 		 428 aa  169  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  33.17 
 
 		 389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  32.84 
 
 		 419 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  29.72 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  31.36 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  31.52 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  32.99 
 
 		 393 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  31.42 
 
 		 396 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  31.28 
 
 		 411 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  32.91 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  31.49 
 
 		 397 aa  159  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  32.3 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>