More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2280 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  100 
 
 
406 aa  821    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  83.99 
 
 
406 aa  679    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  72.59 
 
 
406 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  72.41 
 
 
407 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  72.3 
 
 
409 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  71.89 
 
 
405 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  73.83 
 
 
407 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  59.95 
 
 
412 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  58.21 
 
 
406 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  55.67 
 
 
408 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  55.22 
 
 
415 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  58.31 
 
 
409 aa  428  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  51.63 
 
 
402 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  55.8 
 
 
410 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  52.23 
 
 
413 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  48.51 
 
 
405 aa  402  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  51.46 
 
 
410 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  53.58 
 
 
405 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  50.74 
 
 
410 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  52.36 
 
 
423 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  47.75 
 
 
397 aa  352  7e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  51.09 
 
 
408 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  51.11 
 
 
408 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  48.51 
 
 
418 aa  326  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  46.44 
 
 
411 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  56.25 
 
 
251 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  55.42 
 
 
257 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  55.14 
 
 
257 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  48.05 
 
 
259 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  47.86 
 
 
258 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  50.2 
 
 
255 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  44.18 
 
 
256 aa  223  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  52.59 
 
 
259 aa  222  9e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  45.56 
 
 
250 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  45.38 
 
 
256 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  44.76 
 
 
250 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  41.37 
 
 
259 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  45.04 
 
 
256 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  59.31 
 
 
145 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  57.14 
 
 
153 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  52.67 
 
 
135 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  39.23 
 
 
135 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  38.24 
 
 
135 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  43.8 
 
 
130 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  46.55 
 
 
136 aa  103  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  42.22 
 
 
128 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  42.98 
 
 
130 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  40.88 
 
 
132 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  43.09 
 
 
130 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  43.09 
 
 
130 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  42.42 
 
 
132 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  43.09 
 
 
130 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  43.18 
 
 
132 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  45.83 
 
 
142 aa  100  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  42.28 
 
 
130 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  42.28 
 
 
130 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  35.51 
 
 
129 aa  97.8  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  41.09 
 
 
127 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  35.25 
 
 
133 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  43.18 
 
 
127 aa  92.8  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  38.57 
 
 
137 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  40.6 
 
 
133 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  36.03 
 
 
138 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  28 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  36.99 
 
 
133 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  35.94 
 
 
131 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  35.94 
 
 
137 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  29.55 
 
 
252 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  39.06 
 
 
129 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  36.89 
 
 
130 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  38.84 
 
 
129 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  38.98 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  38.98 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  38.98 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  38.98 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  38.98 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  38.98 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  38.14 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  38.98 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  38.14 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  38.14 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  30.2 
 
 
237 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  33.33 
 
 
131 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  36.52 
 
 
141 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  28.69 
 
 
135 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  36.44 
 
 
133 aa  76.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  36.44 
 
 
133 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  29.59 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  36.44 
 
 
133 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  27.87 
 
 
135 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.22 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  35.65 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  27.05 
 
 
134 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  37.29 
 
 
129 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  37.29 
 
 
129 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  26.45 
 
 
134 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  31.75 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  31.16 
 
 
132 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  27.27 
 
 
306 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 
264 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>