More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2267 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2971  hypothetical protein  87.92 
 
 		 382 aa  726    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0553904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2267  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 389 aa  813    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1728  radical SAM family protein  87.63 
 
 		 388 aa  695    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.791785  normal  0.0366359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1725  radical SAM family protein  87.11 
 
 		 383 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0670141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3571  radical SAM family protein  88.66 
 
 		 386 aa  730    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2680  radical SAM family protein  95.12 
 
 		 389 aa  751    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4256  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  85.6 
 
 		 386 aa  693    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.59824  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4899  radical SAM family protein  63.12 
 
 		 386 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152748  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4168  putative hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein  61.66 
 
 		 388 aa  528  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159717  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5307  radical SAM family protein  60.87 
 
 		 386 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4719  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  61.13 
 
 		 386 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5553  radical SAM domain-containing protein  60.87 
 
 		 386 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3252  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  61.38 
 
 		 386 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0981  radical SAM domain-containing protein  63.24 
 
 		 386 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820842  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1963  radical SAM domain-containing protein  63.24 
 
 		 386 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4131  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  64.75 
 
 		 381 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2243  radical SAM domain-containing protein  63.24 
 
 		 386 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5424  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  60.61 
 
 		 386 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3055  radical SAM domain-containing protein  63.24 
 
 		 386 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4877  radical SAM domain-containing protein  60.61 
 
 		 386 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1268  radical SAM domain-containing protein  63.24 
 
 		 386 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2930  radical SAM domain-containing protein  63.24 
 
 		 386 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0105  radical SAM oxidoreductase  62.7 
 
 		 386 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0060  radical SAM family protein  64.38 
 
 		 387 aa  518  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0850532  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0017  MoaA/NifB/PqqE family protein  62.06 
 
 		 384 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7035  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  62.33 
 
 		 384 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165617 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1287  radical SAM domain-containing protein  64.79 
 
 		 371 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2244  radical SAM domain-containing protein  64.51 
 
 		 371 aa  508  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3245  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  61.39 
 
 		 382 aa  510  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  62.24 
 
 		 384 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1288  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  63.49 
 
 		 392 aa  499  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6342  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  61.98 
 
 		 384 aa  501  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  58.82 
 
 		 382 aa  491  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0969  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  59.69 
 
 		 387 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3768  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  59.43 
 
 		 387 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1831  radical SAM domain-containing protein  59.01 
 
 		 383 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3460  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  59.43 
 
 		 387 aa  488  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3658  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  59.17 
 
 		 387 aa  488  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1745  oxidoreductase  64.37 
 
 		 372 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2560  radical SAM family protein  62.79 
 
 		 369 aa  474  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0538253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0815  MoaA/NifB/PqqE family protein  62.21 
 
 		 371 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2115  radical SAM domain protein  60.96 
 
 		 367 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1774  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  60.96 
 
 		 367 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20630  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  57.31 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2847  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  61.11 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  61.11 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0826  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  60.49 
 
 		 337 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.256838 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3457  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  61.3 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483459 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3361  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  59.62 
 
 		 402 aa  406  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.941975  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0220  radical SAM family protein  58.33 
 
 		 340 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2079  MoaA/NifB/PqqE family Fe-S oxidoreductase  53.75 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1015  radical SAM family Fe-S protein  52.97 
 
 		 366 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0391907  normal  0.466336 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1699  radical SAM domain-containing protein  56.89 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.440195  hitchhiker  0.000169379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1219  radical SAM family protein  58.95 
 
 		 338 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0827  radical SAM family protein  55.82 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.731351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6662  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  53.45 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4083  radical SAM domain-containing protein  54.6 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2595  radical SAM family protein  54.18 
 
 		 332 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.90136  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5711  radical SAM domain-containing protein  53.89 
 
 		 335 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6192  radical SAM domain-containing protein  52.32 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0225613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23060  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  52.24 
 
 		 334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.1711 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2446  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  47.32 
 
 		 336 aa  302  8.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1192  radical SAM domain-containing protein  42.55 
 
 		 332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0685  radical SAM domain-containing protein  43.08 
 
 		 332 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2236  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  43.34 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0865  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2823  radical SAM family protein  43.08 
 
 		 332 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0411588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1017  radical SAM domain-containing protein  41.95 
 
 		 332 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0882  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  42.55 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000626988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3363  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  41.95 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3273  radical SAM domain-containing protein  55.38 
 
 		 157 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347908  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 338 aa  94.7  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  30.61 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  24.38 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  24.89 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.72 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.39 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.26 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.39 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  25.35 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 1002 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13126  molybdenum cofactor biosynthesis protein A moaA1  28.82 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0851136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4636  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.82 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.886465  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  24.49 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 565 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.7 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.66 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  28.98 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.51 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 1005 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  32.79 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  24.37 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>