90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2226 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2226  DNA replication initiation ATPase  100 
 
 		 330 aa  657    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000024836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3518  hypothetical protein  70.44 
 
 		 198 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1941  hypothetical protein  71.74 
 
 		 200 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0327741  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2060  DNA replication initiation ATPase  70.87 
 
 		 203 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1776  hypothetical protein  69.52 
 
 		 213 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0182975  normal  0.0433353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0072  hypothetical protein  59.87 
 
 		 180 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0505  hypothetical protein  50.56 
 
 		 275 aa  165  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0199064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0876  hypothetical protein  55.21 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.878861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0874  hypothetical protein  51.9 
 
 		 272 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0473235  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0573  hypothetical protein  55.06 
 
 		 264 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0468  hypothetical protein  48.31 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.218243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0434  hypothetical protein  48.31 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.953981 
 
 
-
 
NC_004310  BR0572  hypothetical protein  55.06 
 
 		 214 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2687  hypothetical protein  52.53 
 
 		 263 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304956  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4956  hypothetical protein  44.68 
 
 		 282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359557 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1289  hypothetical protein  43.2 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2225  hypothetical protein  44.3 
 
 		 376 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0551964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1483  hypothetical protein  42.33 
 
 		 378 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1775  chromosomal replication initiator, DnaA-like  54.24 
 
 		 131 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141537  normal  0.0422167 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6073  hypothetical protein  42.33 
 
 		 378 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1533  hypothetical protein  42.04 
 
 		 379 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.796419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1584  hypothetical protein  36.31 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16808  normal  0.0492806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1378  hypothetical protein  40.83 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1710  hypothetical protein  43.07 
 
 		 188 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.385544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2069  hypothetical protein  41.01 
 
 		 157 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1372  hypothetical protein  39.23 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396707  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1204  hypothetical protein  39.47 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.843488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1287  hypothetical protein  42.59 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0873  chromosomal replication initiator, DnaA-like  38.83 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0961379  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0875  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  50.63 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0895  hypothetical protein  36.94 
 
 		 237 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610672  normal  0.201664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0073  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  44.21 
 
 		 130 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0571  hypothetical protein  36.46 
 
 		 151 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0572  hypothetical protein  36.46 
 
 		 151 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2688  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0894  DnaA related protein  51.25 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0568885  normal  0.192838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1203  hypothetical protein  48 
 
 		 128 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3097  Sigma 54 interacting domain protein  39.29 
 
 		 426 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.51 
 
 		 490 aa  49.3  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428353  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.29 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.74 
 
 		 446 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2357  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.03 
 
 		 476 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.048166  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.59 
 
 		 477 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35 
 
 		 453 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  40.74 
 
 		 448 aa  46.2  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0003  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 510 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000244231  normal  0.247706 
 
 
-
 
NC_002620  TC0547  chromosomal replication initiation protein  31 
 
 		 455 aa  45.4  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.28 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0301  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 533 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.67 
 
 		 452 aa  45.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000136146 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0089  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 533 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2553  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 561 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0103  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 533 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 533 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2237  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 533 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2848  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 533 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0001  chromosomal replication initiation protein  39.02 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583954  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 518 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 525 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3182  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 525 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.143434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3239  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 536 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 525 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.375862  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 518 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470324 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 525 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470928  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 525 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.54964 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 524 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57647  hitchhiker  0.0000195718 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  41.38 
 
 		 443 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0001  chromosomal replication initiation protein  37.08 
 
 		 479 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0301114  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.67 
 
 		 455 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0001  chromosomal replication initiation protein  38.82 
 
 		 584 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  31.43 
 
 		 436 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3442  chromosomal replication initiation protein  38.82 
 
 		 522 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807856  normal  0.719643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0001  chromosomal replication initiation protein  38.82 
 
 		 529 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0001  chromosomal replication initiation protein  38.82 
 
 		 529 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.88 
 
 		 506 aa  43.1  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.993036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 		 524 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1279  chromosomal replication initiation protein  38.64 
 
 		 524 aa  43.1  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000504678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0001  chromosomal replication initiation protein  39.29 
 
 		 500 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0005  chromosomal replication initiation protein  36.23 
 
 		 475 aa  42.7  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.37 
 
 		 454 aa  42.7  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 445 aa  42.7  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0001  chromosomal replication initiation protein  39.02 
 
 		 475 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  39.13 
 
 		 500 aa  42.7  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0001  chromosomal replication initiation protein  39.02 
 
 		 473 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4462  chromosomal replication initiation protein  38.82 
 
 		 544 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369414  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0001  chromosomal replication initiation protein  37.8 
 
 		 472 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  37.84 
 
 		 533 aa  42.4  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000917685  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0001  chromosomal replication initiation protein  38.82 
 
 		 545 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0001  chromosomal replication initiation protein  37.8 
 
 		 472 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>