More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2225 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  99.68 
 
 
316 aa  659  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  99.68 
 
 
316 aa  657  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  99.68 
 
 
327 aa  658  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  99.68 
 
 
316 aa  659  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  100 
 
 
316 aa  660  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  99.68 
 
 
316 aa  659  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  99.68 
 
 
316 aa  659  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  99.68 
 
 
316 aa  659  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  99.68 
 
 
316 aa  659  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  99.65 
 
 
329 aa  589  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  99.3 
 
 
329 aa  588  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  81.56 
 
 
321 aa  540  1e-152  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  98.73 
 
 
329 aa  491  1e-138  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  98.73 
 
 
286 aa  490  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  71.47 
 
 
319 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  71.47 
 
 
319 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  71.47 
 
 
319 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  71.47 
 
 
319 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  67.09 
 
 
320 aa  462  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  68.09 
 
 
330 aa  458  1e-128  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  68.09 
 
 
330 aa  458  1e-128  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  68.18 
 
 
330 aa  459  1e-128  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  68.18 
 
 
330 aa  460  1e-128  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  68.09 
 
 
330 aa  457  1e-128  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  67.88 
 
 
355 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  67.88 
 
 
348 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  65.17 
 
 
463 aa  452  1e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  73.72 
 
 
277 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  60.61 
 
 
314 aa  390  1e-107  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  58.75 
 
 
320 aa  388  1e-107  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  59.02 
 
 
314 aa  380  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  2.79647e-10 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  82.51 
 
 
303 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  58.49 
 
 
316 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  58.49 
 
 
316 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  58.49 
 
 
316 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  58.49 
 
 
316 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  56.52 
 
 
321 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  58.36 
 
 
316 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  58.36 
 
 
316 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  60.51 
 
 
284 aa  357  2e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  57.58 
 
 
265 aa  308  7e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  100 
 
 
153 aa  306  4e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  69.12 
 
 
221 aa  303  3e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  70.05 
 
 
206 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  81.94 
 
 
188 aa  270  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  57.39 
 
 
259 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  70.3 
 
 
178 aa  242  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  54.4 
 
 
280 aa  213  5e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  67.65 
 
 
170 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  78.18 
 
 
111 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  48.04 
 
 
216 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  38.2 
 
 
329 aa  180  3e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  37.79 
 
 
321 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  37.79 
 
 
333 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  37.79 
 
 
321 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  38.31 
 
 
463 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  36.22 
 
 
323 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  37.73 
 
 
325 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  8.45152e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  38.02 
 
 
325 aa  165  1e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  34.8 
 
 
343 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  34.8 
 
 
332 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  33.64 
 
 
325 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  34.86 
 
 
323 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  35.56 
 
 
497 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  35.56 
 
 
441 aa  154  3e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  35.56 
 
 
329 aa  153  3e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  35.18 
 
 
325 aa  153  3e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  35.18 
 
 
333 aa  153  3e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  36.01 
 
 
325 aa  153  3e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  36.01 
 
 
327 aa  153  3e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  36.01 
 
 
325 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  35.29 
 
 
323 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  33.44 
 
 
323 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  30.56 
 
 
323 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  32.65 
 
 
274 aa  127  2e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0443  integrase, catalytic region  71.43 
 
 
83 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  28.53 
 
 
330 aa  121  1e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0252  transposase (class I)  76.81 
 
 
83 aa  120  4e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  56.44 
 
 
128 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  56.79 
 
 
185 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  30.88 
 
 
238 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5325  hypothetical protein  77.59 
 
 
197 aa  99.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.969651  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  41.76 
 
 
179 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  28.97 
 
 
338 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  36.04 
 
 
216 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  36.04 
 
 
216 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1327  transcriptional regulator, putative  42.75 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2839  transcriptional regulator, putative  43.41 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1603  transcriptional regulator, putative  30.09 
 
 
302 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2732  transcriptional regulator, putative  43.41 
 
 
289 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3201  transcriptional regulator, putative  28.12 
 
 
288 aa  90.1  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  26.94 
 
 
316 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  26.94 
 
 
316 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2665  transcriptional regulator, putative  42.64 
 
 
289 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  26.94 
 
 
316 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2906  transcriptional regulator, putative  40.62 
 
 
288 aa  89.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  26.94 
 
 
316 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1222  transcriptional regulator, putative  25.97 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1424  transcriptional regulator, putative  26.79 
 
 
288 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>