More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2009 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  100 
 
 
196 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  87.96 
 
 
198 aa  290  6e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  76.09 
 
 
196 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4727  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  73.02 
 
 
198 aa  256  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  72.87 
 
 
197 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  75 
 
 
196 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  63.83 
 
 
201 aa  238  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3529  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  69.07 
 
 
203 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.536272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  64.43 
 
 
203 aa  224  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0601  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  63.83 
 
 
201 aa  211  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1357  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  64.43 
 
 
203 aa  211  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0473  hypothetical protein  70.1 
 
 
201 aa  210  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0566  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  63.3 
 
 
201 aa  209  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  55.28 
 
 
214 aa  201  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3637  protein of unknown function DUF205  64.43 
 
 
202 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.646526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3514  protein of unknown function DUF205  63.92 
 
 
202 aa  192  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3314  hypothetical protein  64.95 
 
 
202 aa  192  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3856  protein of unknown function DUF205  57.58 
 
 
204 aa  192  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0565232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1297  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  59.07 
 
 
206 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114938  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1760  hypothetical protein  58.33 
 
 
209 aa  190  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1389  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  59.07 
 
 
206 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.942836  normal  0.154079 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  57.38 
 
 
203 aa  189  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  56.99 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  58.38 
 
 
201 aa  187  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  58.38 
 
 
201 aa  187  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3420  hypothetical protein  63.54 
 
 
197 aa  186  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296095  normal  0.610432 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3917  hypothetical protein  65.8 
 
 
202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  56.99 
 
 
194 aa  180  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4346  hypothetical protein  70.56 
 
 
199 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  51.05 
 
 
211 aa  176  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  55.67 
 
 
212 aa  167  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1208  hypothetical protein  56.08 
 
 
200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1715  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  55.14 
 
 
216 aa  165  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.23261  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  53.48 
 
 
215 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3073  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  56.76 
 
 
202 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  51.35 
 
 
203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3312  protein of unknown function DUF205  69.83 
 
 
200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3192  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  52.26 
 
 
216 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  51.38 
 
 
192 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3906  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  51.69 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.676022  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1800  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  53.16 
 
 
197 aa  145  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428645  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  49.18 
 
 
197 aa  144  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5145  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  49.46 
 
 
189 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  44.44 
 
 
226 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.59 
 
 
212 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0425  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50 
 
 
189 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.954266  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  48.42 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  45.6 
 
 
194 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0391  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.57 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566862  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.31 
 
 
202 aa  138  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001618  acyl-phosphate:glycerol-3-phosphate O-acyltransferase PlsY  44.5 
 
 
203 aa  138  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0411697  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.57 
 
 
189 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.134868  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.84 
 
 
208 aa  138  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0299  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.27 
 
 
216 aa  138  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017898  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0557  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.27 
 
 
216 aa  138  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000206924  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0638  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.27 
 
 
216 aa  138  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  42.78 
 
 
216 aa  137  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.5 
 
 
203 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.23 
 
 
210 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.63 
 
 
198 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1851  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.27 
 
 
226 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2546  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.92 
 
 
207 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4296  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.44 
 
 
212 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0033487  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.35 
 
 
202 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  42.7 
 
 
196 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  36.7 
 
 
195 aa  136  2e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0541  hypothetical protein  50.83 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.54 
 
 
203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.85 
 
 
203 aa  135  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  47.28 
 
 
193 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0827  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.02 
 
 
210 aa  134  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0696875  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  47.92 
 
 
197 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0007  membrane protein  41.76 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.386788  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.88 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  43.48 
 
 
224 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2243  protein of unknown function DUF205  42.71 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.341308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2753  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.71 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.16 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1043  hypothetical protein  40.31 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000725883  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2823  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.88 
 
 
207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1077  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.3 
 
 
200 aa  132  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.116934  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  46.15 
 
 
195 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  42.49 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  46.2 
 
 
193 aa  131  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4024  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.54 
 
 
192 aa  131  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2417  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.88 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4811  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  51.45 
 
 
189 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0293  hypothetical protein  43.59 
 
 
210 aa  131  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0320  protein of unknown function DUF205  43.52 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.254648  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5888  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.42 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3467  hypothetical protein  45.54 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  39.34 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0793  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.39 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.414497  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2382  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.97 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.332777 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3411  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.39 
 
 
211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0338117  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2604  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.91 
 
 
212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1070  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.64 
 
 
203 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0914  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.64 
 
 
203 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0918  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.64 
 
 
203 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3570  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.85 
 
 
211 aa  127  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0795951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>