More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1948 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  100 
 
 
589 aa  1196    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  53.69 
 
 
593 aa  610  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  47.47 
 
 
583 aa  495  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  40.13 
 
 
772 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  46.52 
 
 
398 aa  362  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  47.87 
 
 
403 aa  353  4e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  47.87 
 
 
403 aa  353  5e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2674  acetate kinase  46.67 
 
 
381 aa  352  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  47 
 
 
401 aa  351  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  47.75 
 
 
406 aa  346  8.999999999999999e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  44.33 
 
 
398 aa  342  9e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  44.5 
 
 
399 aa  340  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  46.94 
 
 
380 aa  340  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  45.23 
 
 
396 aa  336  5e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  47.98 
 
 
394 aa  335  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  43.43 
 
 
401 aa  335  1e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  44.25 
 
 
405 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  45.75 
 
 
406 aa  335  2e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  43.78 
 
 
402 aa  334  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  42.64 
 
 
399 aa  330  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  43.11 
 
 
397 aa  330  5.0000000000000004e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  45.86 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  42.25 
 
 
398 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  44.58 
 
 
399 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  44.66 
 
 
422 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  43 
 
 
397 aa  325  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  41.54 
 
 
398 aa  325  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  44.92 
 
 
396 aa  324  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  43.5 
 
 
397 aa  323  6e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  44.58 
 
 
397 aa  323  6e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  41.29 
 
 
398 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  42.61 
 
 
397 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  43.5 
 
 
395 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  40.15 
 
 
404 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  42.96 
 
 
404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  44.42 
 
 
401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  46.33 
 
 
402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  43 
 
 
397 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  40.44 
 
 
398 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  42.93 
 
 
397 aa  316  8e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  42.93 
 
 
397 aa  316  8e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  42.93 
 
 
397 aa  316  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  42.93 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  42.93 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  42.93 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  42.93 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  43.4 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  41.46 
 
 
398 aa  316  9.999999999999999e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  42.49 
 
 
397 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  42.93 
 
 
397 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  49 
 
 
395 aa  315  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  42.68 
 
 
397 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  43.18 
 
 
397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  42.25 
 
 
396 aa  312  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  43.86 
 
 
398 aa  311  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  42.86 
 
 
408 aa  309  8e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  44.83 
 
 
408 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  42.13 
 
 
398 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  40.73 
 
 
421 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  45.84 
 
 
395 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  47.94 
 
 
401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  45.66 
 
 
378 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  42.79 
 
 
398 aa  305  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  40.05 
 
 
397 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11270  acetate kinase  45.36 
 
 
395 aa  304  3.0000000000000004e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0595808  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  42.08 
 
 
414 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  45.2 
 
 
394 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  44.95 
 
 
394 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  42.89 
 
 
417 aa  300  4e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1870  acetate kinase  41.35 
 
 
401 aa  300  4e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3049  acetate kinase  44.39 
 
 
407 aa  300  4e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0947096 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  40 
 
 
399 aa  300  4e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  40.65 
 
 
421 aa  300  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  44.47 
 
 
397 aa  300  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  40.55 
 
 
396 aa  300  6e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  38.83 
 
 
404 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  42.11 
 
 
404 aa  300  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  42.11 
 
 
404 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  42.11 
 
 
404 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  39.8 
 
 
396 aa  299  8e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  42.11 
 
 
404 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  40.3 
 
 
396 aa  299  8e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  42.11 
 
 
404 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  39.23 
 
 
404 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  40.84 
 
 
420 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  42.78 
 
 
409 aa  299  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  40.2 
 
 
406 aa  299  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3504  acetate kinase  39 
 
 
405 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  43.32 
 
 
395 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  45.48 
 
 
398 aa  298  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1180  acetate kinase  43.83 
 
 
414 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  42.86 
 
 
398 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3044  acetate kinase  45.36 
 
 
386 aa  297  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  43.25 
 
 
414 aa  296  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  43.11 
 
 
399 aa  296  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  41.33 
 
 
400 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  41.33 
 
 
400 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3238  acetate kinase  45.18 
 
 
386 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  40.34 
 
 
421 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  40.54 
 
 
417 aa  296  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>