More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1740 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 
753 aa  1512    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  68.13 
 
 
759 aa  1006    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  66.04 
 
 
764 aa  999    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  68.76 
 
 
760 aa  1028    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  88.83 
 
 
756 aa  1347    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  47.03 
 
 
725 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  45.74 
 
 
723 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  44.63 
 
 
723 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  38.66 
 
 
744 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  40.4 
 
 
729 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  39.71 
 
 
754 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 
729 aa  402  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  37.3 
 
 
731 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  29.93 
 
 
721 aa  316  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.64 
 
 
737 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  33.49 
 
 
670 aa  302  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  32.67 
 
 
741 aa  296  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  30.93 
 
 
753 aa  293  9e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.03 
 
 
696 aa  290  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.89 
 
 
758 aa  281  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  31.17 
 
 
734 aa  276  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  29.53 
 
 
794 aa  269  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  29.54 
 
 
746 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.16 
 
 
658 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.44 
 
 
758 aa  262  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  28.64 
 
 
758 aa  253  7e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.3 
 
 
657 aa  253  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  28.96 
 
 
758 aa  250  6e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  28.75 
 
 
738 aa  247  6.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  29.92 
 
 
701 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.86 
 
 
656 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.44 
 
 
672 aa  225  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  31.18 
 
 
650 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  42.86 
 
 
656 aa  220  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  27.49 
 
 
641 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  28.72 
 
 
752 aa  214  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  32.07 
 
 
696 aa  199  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  29.31 
 
 
645 aa  197  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  28.64 
 
 
694 aa  196  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.3 
 
 
643 aa  196  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.34 
 
 
936 aa  195  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  28.31 
 
 
667 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3720  putative Chase2 sensor protein  34.44 
 
 
499 aa  178  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104275  normal  0.235752 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  25.78 
 
 
614 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.29 
 
 
701 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.72 
 
 
652 aa  176  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.41 
 
 
611 aa  173  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  27.12 
 
 
638 aa  172  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2084  putative Chase2 sensor protein  31.02 
 
 
499 aa  170  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.478351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.52 
 
 
761 aa  170  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  25.22 
 
 
665 aa  167  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  31.91 
 
 
708 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.74 
 
 
735 aa  164  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  36.19 
 
 
717 aa  161  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  27.09 
 
 
744 aa  157  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  26.18 
 
 
607 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.09 
 
 
597 aa  155  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  37.19 
 
 
712 aa  153  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  34.36 
 
 
636 aa  151  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  28.4 
 
 
675 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  36.78 
 
 
702 aa  150  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  33.57 
 
 
699 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.67 
 
 
757 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  36.28 
 
 
284 aa  147  7.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  30.13 
 
 
483 aa  146  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  30.13 
 
 
483 aa  145  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  35.87 
 
 
431 aa  145  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  31.87 
 
 
701 aa  144  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  35.65 
 
 
441 aa  144  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  31.86 
 
 
681 aa  144  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  40.28 
 
 
724 aa  144  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  31.87 
 
 
701 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  34.67 
 
 
860 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.9 
 
 
703 aa  140  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
861 aa  140  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  36.8 
 
 
713 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  31.72 
 
 
864 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 
911 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  31.14 
 
 
859 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  37.39 
 
 
593 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.16 
 
 
858 aa  135  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  24.08 
 
 
582 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  30 
 
 
671 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  35.19 
 
 
726 aa  132  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  37.87 
 
 
421 aa  131  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  37.3 
 
 
518 aa  130  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  27.19 
 
 
635 aa  130  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  33.88 
 
 
1207 aa  130  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1897  metal-dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 
671 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.02 
 
 
648 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.29 
 
 
678 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  35.34 
 
 
903 aa  129  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  23.87 
 
 
643 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0632  metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 
654 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000219793  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  36.28 
 
 
536 aa  127  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  29.13 
 
 
632 aa  126  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.45 
 
 
577 aa  125  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  29.39 
 
 
465 aa  123  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  31.84 
 
 
513 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  35.71 
 
 
684 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>