144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1544 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  100 
 
 		 424 aa  875    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  36.07 
 
 		 413 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  36.07 
 
 		 413 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  36.74 
 
 		 420 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  35.81 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  36.96 
 
 		 414 aa  237  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  35 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  36.68 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  40.57 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  37.46 
 
 		 416 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  38.04 
 
 		 440 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  36.32 
 
 		 421 aa  227  4e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  35.77 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  36.43 
 
 		 411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  33.41 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  35.03 
 
 		 407 aa  206  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  35.36 
 
 		 434 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  36.57 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  32.37 
 
 		 417 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  32.77 
 
 		 414 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  32.51 
 
 		 524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  31.15 
 
 		 419 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  31.9 
 
 		 409 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  33.71 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  31.01 
 
 		 431 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  30.11 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  34.55 
 
 		 429 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  30.23 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  32.2 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  32.2 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  32.2 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  31.01 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  31.75 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  29.67 
 
 		 409 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  31.81 
 
 		 412 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  31.64 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  33.79 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  31.94 
 
 		 416 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  32.14 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  28.83 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  30.93 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  32.2 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  32.05 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  29.97 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  30.99 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  30.7 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  29.52 
 
 		 426 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  30.99 
 
 		 416 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  27.88 
 
 		 544 aa  163  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  30.97 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  30.73 
 
 		 420 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  27.44 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  31.02 
 
 		 392 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  31.88 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  30.6 
 
 		 429 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  29.68 
 
 		 389 aa  153  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  31.09 
 
 		 401 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  29.63 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  26.05 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  27.44 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  29.67 
 
 		 408 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  28.15 
 
 		 398 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  28.72 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  27.95 
 
 		 395 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  28.92 
 
 		 445 aa  133  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  28.92 
 
 		 445 aa  133  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  37.5 
 
 		 225 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  26.18 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  28.25 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  27.37 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  24.36 
 
 		 413 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  26.37 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  26.44 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  26.18 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  26.89 
 
 		 392 aa  106  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  28.13 
 
 		 393 aa  106  8e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  22.37 
 
 		 433 aa  106  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  26.63 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  24.65 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  35.14 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  27.58 
 
 		 455 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  25.21 
 
 		 455 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  35.14 
 
 		 391 aa  100  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  25.24 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  27.02 
 
 		 457 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  30.68 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  23.04 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  26.18 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  22.65 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  22.65 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  32.31 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  27.61 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  25.57 
 
 		 372 aa  94.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  24.02 
 
 		 448 aa  93.6  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  31.27 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3150  HK97 family phage portal protein  31.1 
 
 		 393 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273725  normal  0.0302627 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  26.02 
 
 		 859 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  25.75 
 
 		 833 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  26.02 
 
 		 833 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  32.88 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>