286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1502 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1502  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 		 339 aa  677    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  80.53 
 
 		 345 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  65.87 
 
 		 335 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  67.57 
 
 		 336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  66.67 
 
 		 349 aa  434  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2623  allophanate hydrolase subunit 2  68.86 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  66.88 
 
 		 335 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  44.18 
 
 		 339 aa  229  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  46.13 
 
 		 339 aa  222  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  46.13 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1495  urea amidolyase related protein  41.84 
 
 		 344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0419081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  36.16 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1105  urea amidolyase related protein  39.94 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0170901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1708  urea amidolyase related protein  44 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0203426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  36.68 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  39.47 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  39.93 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  38.34 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1505  allophanate hydrolase subunit 2  39.13 
 
 		 353 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  42.09 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  37.25 
 
 		 348 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  40.19 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  34.56 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  38.94 
 
 		 349 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  40.91 
 
 		 339 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3142  urea amidolyase related protein  34.97 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  41.61 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1384  urea amidolyase related protein  35.54 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.669414 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3431  urea amidolyase related protein  41.14 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2133  urea amidolyase related protein  40.14 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  36.06 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  40.13 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  38.41 
 
 		 314 aa  169  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  37.08 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0520  urea amidolyase related protein  38.82 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  37.08 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  37.08 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  37.08 
 
 		 371 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  37.08 
 
 		 371 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  37.08 
 
 		 371 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  37.08 
 
 		 371 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3354  urea amidolyase related protein  39.88 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  37.2 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  37.2 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  37.2 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  36.14 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  36.91 
 
 		 350 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  38.41 
 
 		 314 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  37.08 
 
 		 356 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  37.2 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  37.2 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  37.2 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  35.9 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  36.89 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.2 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  37.2 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  36.28 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  37.08 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  37.3 
 
 		 316 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  36.28 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  36.78 
 
 		 359 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  34.34 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.3 
 
 		 316 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  37.2 
 
 		 310 aa  159  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  39.72 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  36.22 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  31.46 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  36.22 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  36.22 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  37.54 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  36.22 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  36.98 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  35.48 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  36.86 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  31.46 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  37.79 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  35.84 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  35.84 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  35.84 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  35.9 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  35.25 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  35.87 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  35.14 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  35.62 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  30.58 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  37.1 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  36 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  36.52 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  35.06 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  32.89 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  34.43 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2804  allophanate hydrolase subunit 2  35.43 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.776372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4096  urea amidolyase related protein  35.6 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  33.01 
 
 		 329 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  36.9 
 
 		 286 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  29.91 
 
 		 329 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  36.68 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  30.75 
 
 		 329 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  30.77 
 
 		 329 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1499  allophanate hydrolase subunit 2  36.96 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0738135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>