107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1482 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 385 aa  780    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 385 aa  780    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  66.06 
 
 		 390 aa  500  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  59.58 
 
 		 385 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  58.42 
 
 		 385 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  50 
 
 		 382 aa  355  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  50 
 
 		 382 aa  355  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  48.83 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  46.67 
 
 		 384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  45.29 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  42.11 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  42.02 
 
 		 403 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  39.4 
 
 		 420 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  34.88 
 
 		 424 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  33.5 
 
 		 416 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  37.1 
 
 		 417 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  35.15 
 
 		 418 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  36.23 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  34.34 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  34.65 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  34.67 
 
 		 431 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  32.75 
 
 		 403 aa  172  9e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  33.25 
 
 		 421 aa  170  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  31.92 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  32.99 
 
 		 421 aa  167  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  33.33 
 
 		 380 aa  166  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  31.89 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  36.15 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  33.17 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  31.61 
 
 		 421 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  32.67 
 
 		 425 aa  163  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  32.38 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  33.44 
 
 		 450 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  35.08 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  33.44 
 
 		 380 aa  157  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  33.08 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  34.84 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  32.95 
 
 		 388 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  30.99 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  29.74 
 
 		 405 aa  152  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  31.82 
 
 		 471 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  33.07 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  33.85 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  33.64 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  33.85 
 
 		 405 aa  142  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  35.63 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  29.77 
 
 		 399 aa  136  5e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  27.68 
 
 		 383 aa  136  5e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  32.88 
 
 		 400 aa  136  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  28.73 
 
 		 388 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  33.16 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  31.75 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  32.9 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  34.05 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  29.32 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  27.54 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  28.72 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  29.32 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  29.97 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  27.69 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  28.24 
 
 		 388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  26.97 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  26.97 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  28.05 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  30.27 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  28.87 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  28.57 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  30.47 
 
 		 312 aa  94  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  29.51 
 
 		 417 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  27.44 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  24.09 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  24.09 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  24.09 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  26.45 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  29.27 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  27.75 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  24.72 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  28.48 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  21.9 
 
 		 562 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  27.08 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  27.16 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  24.02 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  26.4 
 
 		 624 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  26.4 
 
 		 624 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  26.38 
 
 		 624 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  25.62 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  22.37 
 
 		 479 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  25.97 
 
 		 624 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  23.76 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  24.06 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1719  HK97 family phage major capsid protein  22.36 
 
 		 429 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  27.43 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  24.55 
 
 		 483 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  28.15 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2469  hypothetical protein  54.55 
 
 		 108 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  24.89 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1985  phage major capsid protein, HK97  23.68 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2866  phage major capsid protein, HK97  23.68 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  25.42 
 
 		 444 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7144  HK97 family phage major capsid protein  21.9 
 
 		 434 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647338 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>