92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1410 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1410  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
393 aa  803    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  87.69 
 
 
392 aa  709    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  67.26 
 
 
392 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  66.93 
 
 
388 aa  525  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  65.8 
 
 
394 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  62.11 
 
 
394 aa  502  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  60.1 
 
 
389 aa  471  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  54.99 
 
 
391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0761  saccharopine dehydrogenase  59.85 
 
 
390 aa  441  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.092015  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  56.89 
 
 
390 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1467  saccharopine dehydrogenase  45.48 
 
 
413 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.071229  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  47.17 
 
 
414 aa  342  7e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6531  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  45.61 
 
 
416 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  0.0830191 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5681  saccharopine dehydrogenase  45.74 
 
 
416 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6045  saccharopine dehydrogenase  45.74 
 
 
416 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  45.21 
 
 
414 aa  335  9e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  42.03 
 
 
432 aa  333  3e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  44.26 
 
 
419 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  45.63 
 
 
413 aa  332  8e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  44.72 
 
 
414 aa  328  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  42.26 
 
 
432 aa  325  1e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6092  saccharopine dehydrogenase  44.05 
 
 
419 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207649  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  40.82 
 
 
419 aa  317  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1758  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  43.03 
 
 
407 aa  311  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.819467 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  41.52 
 
 
419 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  38.46 
 
 
422 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  39.9 
 
 
422 aa  252  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  39.36 
 
 
419 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  40.1 
 
 
420 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  40 
 
 
404 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  39.36 
 
 
419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  39.36 
 
 
419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3953  saccharopine dehydrogenase  41.19 
 
 
421 aa  239  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0682928  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  38.48 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  35.94 
 
 
410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  39.47 
 
 
430 aa  219  8.999999999999998e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  33.09 
 
 
405 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  39.07 
 
 
410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  36.43 
 
 
418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  35.07 
 
 
421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  37.75 
 
 
409 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  40.05 
 
 
389 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  39.7 
 
 
389 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  37.56 
 
 
398 aa  205  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  37.76 
 
 
386 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  37.84 
 
 
391 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  36.39 
 
 
406 aa  203  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  39.45 
 
 
388 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  36.45 
 
 
390 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  32.68 
 
 
502 aa  186  7e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  34.88 
 
 
377 aa  183  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.29 
 
 
402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  34.63 
 
 
404 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89710  predicted protein  31.93 
 
 
436 aa  150  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.332936 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03750  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 
427 aa  145  9e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  26.23 
 
 
498 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  26.32 
 
 
1506 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  25.4 
 
 
430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  31.89 
 
 
382 aa  89.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  34.64 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  31.36 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  32.61 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  34 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  33.77 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  33.77 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  33.33 
 
 
376 aa  63.5  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  36.24 
 
 
343 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  34.51 
 
 
365 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  32.62 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  33.8 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  33.8 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  26.52 
 
 
350 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  29.33 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  33.96 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  29.93 
 
 
351 aa  57  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 
371 aa  56.6  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  28.28 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  27.66 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  28.66 
 
 
351 aa  51.6  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  28.27 
 
 
353 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  28.66 
 
 
351 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0316  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424303  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  28.09 
 
 
345 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  30.6 
 
 
351 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  30.09 
 
 
340 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  29.71 
 
 
351 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  29.83 
 
 
376 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  30.2 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  25.34 
 
 
377 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  30.2 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  22.56 
 
 
367 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4354  saccharopine dehydrogenase  29.53 
 
 
376 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>