More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1290 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  98.67 
 
 
176 aa  157  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  98.67 
 
 
176 aa  157  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  98.67 
 
 
176 aa  157  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  98.67 
 
 
176 aa  157  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  98.67 
 
 
122 aa  156  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  98.67 
 
 
122 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  98.67 
 
 
122 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  98.67 
 
 
122 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  98.67 
 
 
122 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  98.67 
 
 
122 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  98.67 
 
 
122 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  98.67 
 
 
122 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2923  transposase, IS4  98.67 
 
 
122 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  98.67 
 
 
122 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  98.67 
 
 
122 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  98.67 
 
 
157 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0215  IS4 family transposase  100 
 
 
75 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1290  IS4 family transposase  100 
 
 
75 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.34094 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2924  IS4 family transposase  100 
 
 
75 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1323  ISCc1, transposase OrfB  79.73 
 
 
101 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  54.67 
 
 
260 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  55.56 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  55.56 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  55.56 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  55.56 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  55.56 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  45.95 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  45.95 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  45.95 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  45.95 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  54.29 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0836  IS4 family transposase  51.35 
 
 
75 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  44.59 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  48 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  44.59 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  44.59 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  47.89 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  47.89 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  49.3 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  47.89 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  47.89 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  47.89 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0078  putative transposase  48.39 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  45.71 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  46.97 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  46.97 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  46.97 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  46.48 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  46.58 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  46.97 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  51.61 
 
 
249 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0514  transposase, interruption-C  45.21 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.414231  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  45.45 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3060  hypothetical protein  46.77 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_004310  BR0135  IS711, transposase orfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0527  IS711, transposase orfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15582  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0219  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0482  IS711, transposase orfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1673  IS711, transposase orfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0847  IS711, transposase orfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.791193  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1132  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000184131  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0725  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1154  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0781  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1551  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1381  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.879769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0914  IS711, transposase orfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1142  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319477  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  50 
 
 
249 aa  62.8  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0519  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0923  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0791426  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0721  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0027  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1718  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1932  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1330  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0345  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.932854  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0920  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0130  IS711, transposase orfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00263844  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1037  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0972527  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0720  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0158  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00557351  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0419  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0531  IS711, transposase orfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0327  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0264  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.64372  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0514  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0204  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  45.07 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  45.07 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  45.07 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  45.07 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0470  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1234  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.177063  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0748  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0838  transposase OrfB  48 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.578121  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  43.24 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  45.83 
 
 
123 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  43.24 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>