More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1200 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.05 
 
 		 770 aa  763    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 779 aa  1581    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.03 
 
 		 782 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  73.73 
 
 		 771 aa  1138    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  74.27 
 
 		 775 aa  1114    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  72.58 
 
 		 774 aa  1121    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  72.56 
 
 		 771 aa  1132    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  86.5 
 
 		 775 aa  1317    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  71.71 
 
 		 769 aa  1121    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.77 
 
 		 764 aa  634  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 797 aa  630  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 		 795 aa  628  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  44.04 
 
 		 783 aa  615  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  44.04 
 
 		 783 aa  615  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 		 784 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.63 
 
 		 769 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  44.85 
 
 		 786 aa  600  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 786 aa  598  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.52 
 
 		 786 aa  595  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 769 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 		 774 aa  595  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 772 aa  592  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  42.52 
 
 		 790 aa  574  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2369  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 793 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315374 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  39.38 
 
 		 773 aa  539  9.999999999999999e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.48 
 
 		 600 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.57 
 
 		 911 aa  411  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 844 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 661 aa  246  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.91 
 
 		 798 aa  231  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 		 523 aa  224  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 1169 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 778 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.91 
 
 		 502 aa  220  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 773 aa  219  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 		 617 aa  214  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 620 aa  211  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0025  histidine kinase  33.55 
 
 		 849 aa  211  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1357  cytoplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.55 
 
 		 849 aa  211  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  48.48 
 
 		 508 aa  210  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 856 aa  209  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 		 389 aa  208  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 		 562 aa  207  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 		 513 aa  204  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  30.16 
 
 		 786 aa  204  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  43.8 
 
 		 513 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  43.8 
 
 		 513 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  43.65 
 
 		 503 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 513 aa  200  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  38.39 
 
 		 599 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.8 
 
 		 1352 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 587 aa  198  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  45.12 
 
 		 513 aa  198  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 1313 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 		 511 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 646 aa  197  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  41.34 
 
 		 1046 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 505 aa  196  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  42.86 
 
 		 532 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 		 1313 aa  196  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 846 aa  196  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 		 530 aa  195  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 614 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 531 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 		 536 aa  194  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 		 533 aa  193  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 		 579 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 		 927 aa  193  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0015  histidine kinase  32.75 
 
 		 868 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 717 aa  193  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 		 530 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 		 536 aa  191  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  39.11 
 
 		 470 aa  191  5e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  41.84 
 
 		 1410 aa  191  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  42.04 
 
 		 288 aa  190  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 436 aa  190  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.257658  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 		 583 aa  189  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 		 917 aa  189  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 377 aa  187  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 484 aa  187  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 1276 aa  187  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 1138 aa  187  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 1296 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.77 
 
 		 1363 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 630 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 1127 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  31.52 
 
 		 823 aa  184  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0577  sensor histidine kinase  41.04 
 
 		 609 aa  184  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.704828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0577  sensor histidine kinase  41.04 
 
 		 609 aa  184  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  43.61 
 
 		 525 aa  184  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 		 1058 aa  184  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 446 aa  184  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0265  histidine kinase  29.34 
 
 		 716 aa  183  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 		 1622 aa  183  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  39.77 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  39.62 
 
 		 461 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 704 aa  182  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 631 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>