282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1136 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 256 aa  494  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  93.75 
 
 		 256 aa  414  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  81.35 
 
 		 256 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  77.38 
 
 		 255 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  79.45 
 
 		 255 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  77.87 
 
 		 255 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  75 
 
 		 255 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  49.54 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  47.3 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  45 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  47.28 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  46.47 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  43.37 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  48.55 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  46.47 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  40.1 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  37.74 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  32.16 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  32.13 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  31.22 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  38.73 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  38.73 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  35.94 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  34.04 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  28.81 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  35.89 
 
 		 265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  32.26 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  31.07 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  33.17 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  30.89 
 
 		 259 aa  111  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  30.41 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  29.74 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  28.5 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  38.39 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  32.14 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  28.22 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  30.13 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  30.84 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  30.51 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  35.02 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  34.1 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  32.85 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  32.22 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  24.89 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  34.95 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  32.37 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  30.08 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  31.94 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  31.44 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  29.69 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  26.12 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  30.8 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  29.36 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  27.35 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  30.04 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  31.06 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  29.31 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  31.06 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  31.06 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  29.95 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  29.95 
 
 		 254 aa  99.4  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  28.04 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  28.45 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  27.27 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  26.47 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  29.36 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  30.77 
 
 		 265 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  27.27 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  30.36 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  31.62 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  29.83 
 
 		 263 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  26.86 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  32.35 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  26.89 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  34.01 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  29.36 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  27.02 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  31.44 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  29.71 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  30.34 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  29.54 
 
 		 265 aa  95.5  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  32.42 
 
 		 253 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  27.78 
 
 		 248 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  29.6 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  28.27 
 
 		 265 aa  95.1  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  27.44 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  30.13 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  28.27 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  31.44 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  33.64 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  26.91 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  24.39 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  30.43 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  28.38 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>