258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1100 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  100 
 
 		 622 aa  1222    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  82.45 
 
 		 619 aa  1007    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  61.21 
 
 		 611 aa  724    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  52.79 
 
 		 623 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  53.11 
 
 		 623 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  52.22 
 
 		 626 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  52.4 
 
 		 623 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  38.68 
 
 		 613 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  38.5 
 
 		 623 aa  349  7e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  37.46 
 
 		 632 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  37.46 
 
 		 632 aa  339  7e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  36.72 
 
 		 632 aa  330  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  38.41 
 
 		 623 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  34.85 
 
 		 618 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  35.56 
 
 		 627 aa  278  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  30.48 
 
 		 599 aa  196  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  31.92 
 
 		 588 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  30.4 
 
 		 588 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  32.45 
 
 		 486 aa  133  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  29.95 
 
 		 587 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  30.09 
 
 		 457 aa  126  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  30.68 
 
 		 477 aa  124  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  31.09 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  31.33 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  32.63 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  28.13 
 
 		 727 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  31.55 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  31.76 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  29.29 
 
 		 585 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  28.91 
 
 		 548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  25.07 
 
 		 846 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  32.33 
 
 		 485 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 		 631 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  28.4 
 
 		 482 aa  110  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  27.68 
 
 		 631 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  23.67 
 
 		 847 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  24.51 
 
 		 818 aa  107  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  30.18 
 
 		 657 aa  105  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  28.81 
 
 		 554 aa  104  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  28.81 
 
 		 554 aa  104  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  28.81 
 
 		 554 aa  104  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  28.38 
 
 		 456 aa  104  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  26.51 
 
 		 478 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  25.23 
 
 		 566 aa  103  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  27.16 
 
 		 920 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  29.03 
 
 		 838 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  28.63 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  30.3 
 
 		 546 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  32.33 
 
 		 660 aa  102  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  28.32 
 
 		 688 aa  102  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  29.25 
 
 		 713 aa  101  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  25.14 
 
 		 531 aa  101  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  24.74 
 
 		 644 aa  100  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  28.69 
 
 		 683 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  23.74 
 
 		 641 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  28.22 
 
 		 476 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  30.36 
 
 		 457 aa  99.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  30.34 
 
 		 457 aa  99.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  28.7 
 
 		 682 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1710  flagellar hook-associated protein FlgK  33.47 
 
 		 1363 aa  97.8  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447823  normal  0.0702953 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  29.76 
 
 		 457 aa  97.8  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  26.67 
 
 		 858 aa  97.4  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0074  FlgK flagellar hook-associated protein 1  33.47 
 
 		 1363 aa  97.8  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 		 493 aa  97.8  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  33.49 
 
 		 465 aa  97.4  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  24.19 
 
 		 641 aa  97.4  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  26.44 
 
 		 539 aa  97.1  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  26.67 
 
 		 858 aa  97.1  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  28.82 
 
 		 484 aa  97.1  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  28.61 
 
 		 640 aa  97.1  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  30.93 
 
 		 657 aa  97.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  32.48 
 
 		 667 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  32.48 
 
 		 667 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  28.61 
 
 		 547 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  29.11 
 
 		 458 aa  96.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  32.48 
 
 		 667 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  32.48 
 
 		 667 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  32.48 
 
 		 714 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  32.48 
 
 		 667 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  32.48 
 
 		 667 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  28.32 
 
 		 547 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  28.32 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  28.32 
 
 		 547 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  28.24 
 
 		 547 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  30.05 
 
 		 553 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  30.05 
 
 		 553 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  27.78 
 
 		 696 aa  96.3  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  28.07 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  28.07 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  30.05 
 
 		 553 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  28.07 
 
 		 547 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  30.05 
 
 		 553 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  26.57 
 
 		 454 aa  95.5  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  30.05 
 
 		 553 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  28 
 
 		 541 aa  95.5  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  29.83 
 
 		 487 aa  95.5  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  26.05 
 
 		 457 aa  95.1  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  29.46 
 
 		 486 aa  94.7  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  28.32 
 
 		 547 aa  94.7  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  31.03 
 
 		 665 aa  94.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.719396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>