More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1050 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1050  cell cycle protein  100 
 
 
383 aa  756    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00180763  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1278  cell cycle protein  92.69 
 
 
382 aa  664    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.959004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3307  cell cycle protein  84.07 
 
 
383 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1993  cell cycle protein  82.48 
 
 
381 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273485  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3395  cell cycle protein  82.48 
 
 
381 aa  584  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4049  cell division protein FtsW  81.02 
 
 
380 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6175  essential cell division protein (stabilizes FtsZ ring)  79.11 
 
 
383 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1190  cell division protein FtsW  64.31 
 
 
399 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  57.41 
 
 
386 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  57.03 
 
 
385 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  57.3 
 
 
385 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3486  cell cycle protein  56.88 
 
 
398 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2855  cell division protein FtsW  54.57 
 
 
384 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2595  cell division protein FtsW  54.84 
 
 
384 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  54.89 
 
 
388 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  54.08 
 
 
388 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  54.08 
 
 
388 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2008  cell division protein FtsW  55.87 
 
 
384 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0298176  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2083  cell division protein FtsW  54.52 
 
 
384 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  hitchhiker  0.00100012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  54.35 
 
 
388 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0691  cell cycle protein  54.17 
 
 
380 aa  408  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145993  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2892  cell division protein  53.49 
 
 
384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2420  cell division protein FtsW  55.49 
 
 
382 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.737508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7444  cell cycle protein  53.72 
 
 
379 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0948  cell division protein FtsW  49.47 
 
 
386 aa  381  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6705  cell cycle protein  54.26 
 
 
379 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0951  cell cycle protein  47.14 
 
 
392 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215554  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  48.88 
 
 
375 aa  344  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3667  cell division protein FtsW  47.67 
 
 
390 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249047  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3171  cell cycle protein  45.6 
 
 
387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.0069748  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0681  cell division protein FtsW  42.82 
 
 
389 aa  288  8e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2424  putative cell division protein ftsW  42.7 
 
 
388 aa  256  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0439759  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0062  cell cycle protein  42.05 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1882  cell cycle protein  41.47 
 
 
410 aa  251  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2761  cell cycle protein  37.74 
 
 
395 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.355007  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3948  cell cycle protein  39.35 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0692  cell division protein FtsW  41.71 
 
 
388 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0782  cell division protein FtsW  42.25 
 
 
388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18598  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2106  cell division protein FtsW  42.25 
 
 
388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4496  cell division protein FtsW  41.53 
 
 
389 aa  229  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0394  cell division protein FtsW, putative  38.7 
 
 
371 aa  219  5e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.612635  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1132  cell cycle protein  39.4 
 
 
397 aa  216  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.91568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  35.29 
 
 
375 aa  186  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  32.45 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  32.45 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  36.41 
 
 
399 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  36.41 
 
 
399 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3812  cell division protein FtsW  31.17 
 
 
405 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4534  cell division protein FtsW  30.05 
 
 
404 aa  176  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  33.15 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  30.89 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0385  cell division protein FtsW  29.66 
 
 
403 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0110798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0486  cell division protein FtsW  29.66 
 
 
403 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  29.66 
 
 
403 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  33.61 
 
 
368 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4220  cell division protein FtsW  29.13 
 
 
403 aa  170  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  31.96 
 
 
400 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  29.4 
 
 
403 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0354  phosphopantetheine attachment site  31.08 
 
 
404 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004491  cell division protein FtsW  30.16 
 
 
398 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3805  cell division protein FtsW  30.6 
 
 
404 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  33.61 
 
 
368 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2495  cell cycle protein  35.43 
 
 
386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2430  cell division protein FtsW  34.62 
 
 
398 aa  167  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  33.79 
 
 
369 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  33.24 
 
 
374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0567  cell cycle protein  33.16 
 
 
389 aa  166  9e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00901  hypothetical protein  30.42 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0943  cell division protein FtsW  34.43 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  34.75 
 
 
359 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1974  cell division protein  31.45 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0222  cell division protein FtsW  31.72 
 
 
372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0409  cell division protein FtsW  29.87 
 
 
410 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0353  cell division protein FtsW  29.23 
 
 
402 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000708854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0426  cell division protein FtsW  29.78 
 
 
403 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3454  cell division protein FtsW  27.87 
 
 
404 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0768  cell division protein FtsW  33.53 
 
 
400 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.626093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  32.78 
 
 
363 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0412  cell division protein FtsW  29.78 
 
 
403 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0401  cell division protein FtsW  29.78 
 
 
403 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0400  cell division protein FtsW  29.78 
 
 
403 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0166  cell division protein FtsW  33.33 
 
 
423 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.582847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  32.86 
 
 
375 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2202  cell division protein FtsW  35.19 
 
 
400 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244408  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0601  cell division protein FtsW  32.45 
 
 
441 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0847  cell division protein FtsW  32.52 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.830449  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3520  cell division protein FtsW  32.09 
 
 
487 aa  156  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13240  cell division protein FtsW  36.96 
 
 
406 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.681757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0921  cell division protein FtsW  34.4 
 
 
402 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.524737  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4674  cell cycle protein  35.97 
 
 
405 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000737984  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  31.56 
 
 
371 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4103  cell cycle protein  36.7 
 
 
404 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2092  cell division protein FtsW  33.42 
 
 
395 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0180  cell division protein FtsW  32.28 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.598529  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4513  cell division protein FtsW  34.97 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.444721  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1336  cell division protein FtsW  34.7 
 
 
404 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.820801  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4466  cell division protein FtsW  31.1 
 
 
437 aa  153  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4388  cell division protein FtsW  34.7 
 
 
404 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503964  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2615  cell division protein FtsW  32.46 
 
 
397 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000584566 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  30.28 
 
 
367 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>