More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1023 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  489  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  69.78 
 
 		 226 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  62.45 
 
 		 242 aa  301  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  61.6 
 
 		 242 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  56.85 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  57.02 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  55.7 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  55.37 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  46.22 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  41.67 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  44.12 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  44.13 
 
 		 246 aa  164  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  39.66 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  41.74 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  42.86 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  40.54 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  40.99 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  37.61 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  41.89 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  40.17 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  36.36 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  38.94 
 
 		 223 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  35.06 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  34.63 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  39.45 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  38.52 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  34.22 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  35.11 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  39.25 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  39.57 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  37.71 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  41.1 
 
 		 153 aa  99.8  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  41.22 
 
 		 154 aa  99.4  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  38.18 
 
 		 339 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  38.62 
 
 		 132 aa  96.3  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  39.04 
 
 		 153 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  38 
 
 		 152 aa  93.2  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  35.86 
 
 		 152 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.65 
 
 		 338 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  37.09 
 
 		 149 aa  91.7  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  33.62 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  35.17 
 
 		 152 aa  90.9  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  36.11 
 
 		 148 aa  88.6  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  34.57 
 
 		 339 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  37.84 
 
 		 348 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  33.79 
 
 		 153 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  33.79 
 
 		 153 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  34.46 
 
 		 147 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  32.75 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  32.14 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  34.48 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  35.81 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  33.79 
 
 		 332 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  38.3 
 
 		 133 aa  80.9  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  32.67 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  29.61 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  32.84 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  32.19 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  31.72 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  33.13 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  30.82 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  32.52 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  30.14 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  34.25 
 
 		 157 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  34.53 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  31.36 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  31.03 
 
 		 155 aa  74.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  35.92 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  37.32 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  37.5 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  36.88 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  34.81 
 
 		 158 aa  72  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  32.43 
 
 		 151 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  32.41 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  29.33 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  29.73 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  31.77 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  31.61 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  30.67 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  31.9 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  31.29 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  27.19 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  36.81 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  29.53 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  28.19 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  30.61 
 
 		 413 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  35.71 
 
 		 769 aa  68.6  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  33.74 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  31.65 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  32.5 
 
 		 160 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  30.61 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>