More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0963 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  100 
 
 
447 aa  900    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  90.16 
 
 
447 aa  825    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  46.24 
 
 
444 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  42.86 
 
 
449 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4324  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  42.21 
 
 
449 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4335  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  44.94 
 
 
443 aa  339  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526899  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.67 
 
 
432 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.22 
 
 
435 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.94 
 
 
420 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.43 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.96 
 
 
505 aa  251  1e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.25 
 
 
492 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.54 
 
 
505 aa  248  2e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  33.71 
 
 
436 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.01 
 
 
471 aa  246  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0064  putative type I secretion protein, HlyD family  33.03 
 
 
429 aa  243  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.3 
 
 
445 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.89 
 
 
440 aa  240  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  35.27 
 
 
661 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  32.51 
 
 
506 aa  236  8e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.41 
 
 
480 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.94 
 
 
479 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.89 
 
 
448 aa  226  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.89 
 
 
448 aa  226  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  33.56 
 
 
441 aa  226  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1113  ABC transporter membrane spanning protein (bacteriocin)  31.47 
 
 
462 aa  226  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  33.82 
 
 
446 aa  226  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.54 
 
 
455 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  31.48 
 
 
427 aa  224  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.54 
 
 
481 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.18 
 
 
440 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  34.25 
 
 
446 aa  220  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.26 
 
 
437 aa  219  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.5 
 
 
477 aa  219  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.94 
 
 
431 aa  218  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  31.6 
 
 
435 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.44 
 
 
438 aa  216  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.78 
 
 
433 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.82 
 
 
408 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.5 
 
 
446 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.54 
 
 
447 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.48 
 
 
473 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05157  hypothetical protein  32.13 
 
 
446 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.08 
 
 
442 aa  210  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.94 
 
 
451 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.63 
 
 
440 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.87 
 
 
454 aa  207  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.72 
 
 
435 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8003  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.34 
 
 
460 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.95 
 
 
455 aa  206  8e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.21 
 
 
448 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.37 
 
 
442 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  32.03 
 
 
443 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1509  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.55 
 
 
471 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.09 
 
 
438 aa  204  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  30.75 
 
 
447 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.14 
 
 
454 aa  202  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  31.72 
 
 
443 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  30.91 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.56 
 
 
433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  29.56 
 
 
433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.34 
 
 
433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.1 
 
 
435 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.15 
 
 
440 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.3 
 
 
442 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.03 
 
 
457 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.13 
 
 
441 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1665  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.72 
 
 
448 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1982  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.72 
 
 
448 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.34 
 
 
458 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.13 
 
 
453 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.64 
 
 
460 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.35 
 
 
462 aa  193  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.7 
 
 
494 aa  192  8e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.08 
 
 
446 aa  190  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1275  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.6 
 
 
460 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.37 
 
 
445 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.23 
 
 
446 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.23 
 
 
446 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.19 
 
 
455 aa  186  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.95 
 
 
471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.39 
 
 
436 aa  184  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.848242  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3834  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.17 
 
 
439 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0519478  normal  0.0754142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.11 
 
 
453 aa  183  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.77 
 
 
446 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.66 
 
 
417 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.15 
 
 
452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.15 
 
 
452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  30.09 
 
 
488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.82 
 
 
674 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.31 
 
 
445 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.96 
 
 
453 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.17 
 
 
443 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.23 
 
 
427 aa  170  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.73 
 
 
453 aa  169  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.26 
 
 
390 aa  169  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.35 
 
 
448 aa  169  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  29.17 
 
 
442 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0434  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.68 
 
 
435 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  28.8 
 
 
432 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>