25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0940 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  687    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  59.77 
 
 
347 aa  330  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  50.73 
 
 
362 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3949  hypothetical protein  53.55 
 
 
325 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.315669  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  49.38 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3710  hypothetical protein  52.91 
 
 
323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6682  hypothetical protein  33.85 
 
 
567 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0015  hypothetical protein  34.2 
 
 
290 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2933  hypothetical protein  31.52 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  34.21 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0663  hypothetical protein  33.53 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0010  hypothetical protein  39.86 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0016  hypothetical protein  33.99 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.571689  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0017  hypothetical protein  33.11 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0018  hypothetical protein  33.11 
 
 
278 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1125  hypothetical protein  31.28 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.730205  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6501  hypothetical protein  43.9 
 
 
208 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0732  hypothetical protein  34.44 
 
 
161 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0653  hypothetical protein  40.68 
 
 
188 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.344221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0316  conserved hypothetical conserved membrane protein  34.07 
 
 
180 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0348  hypothetical protein  34.78 
 
 
180 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0690  hypothetical protein  40 
 
 
189 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154988  normal  0.145005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0254  hypothetical protein  44.9 
 
 
190 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0679  hypothetical protein  40 
 
 
189 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3865  hypothetical protein  25.25 
 
 
476 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>