More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0882 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  100 
 
 
259 aa  535  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  78.99 
 
 
260 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  78.6 
 
 
260 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  78.99 
 
 
260 aa  427  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  78.6 
 
 
260 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  78.99 
 
 
260 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  77.82 
 
 
260 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  73.05 
 
 
260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  73.05 
 
 
260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  73.05 
 
 
260 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  72.66 
 
 
260 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  73.05 
 
 
260 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  72.66 
 
 
260 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  71.32 
 
 
260 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  71.32 
 
 
260 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  71.32 
 
 
262 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  70.93 
 
 
260 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0451  class II aldolase/adducin domain protein  71.21 
 
 
261 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  69.38 
 
 
260 aa  380  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0280  class II aldolase/adducin domain protein  70.93 
 
 
260 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.594918  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1957  class II aldolase/adducin domain protein  70.93 
 
 
260 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0957  class II aldolase/adducin domain protein  70.93 
 
 
260 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0868  class II aldolase/adducin domain protein  70.93 
 
 
260 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  66.13 
 
 
258 aa  349  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4438  class II aldolase/adducin domain protein  58.14 
 
 
258 aa  332  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  55.56 
 
 
260 aa  292  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  37.5 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  34.91 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  37.04 
 
 
244 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  34.16 
 
 
282 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  38.76 
 
 
298 aa  122  6e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  32.81 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  33.62 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  34.47 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1648  class II aldolase/adducin family protein  32.47 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  32.1 
 
 
268 aa  118  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  35.56 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  36.87 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  33.06 
 
 
277 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111284 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  36.6 
 
 
301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  34.86 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  34.33 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  33.19 
 
 
281 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  35.62 
 
 
274 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  32.47 
 
 
263 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4135  class II aldolase/adducin family protein  27.88 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  34.54 
 
 
279 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  34.45 
 
 
279 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  33.73 
 
 
281 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  34.85 
 
 
283 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  34.45 
 
 
279 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  34.45 
 
 
279 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  33.61 
 
 
279 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0873  class II aldolase/adducin-like  29.76 
 
 
242 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.137021  normal  0.149254 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  33.99 
 
 
280 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  35.23 
 
 
301 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  31.76 
 
 
261 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  34.27 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  34.27 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  31.54 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  33.04 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  34.36 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  35.36 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  30.42 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  32.67 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  34.31 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  30 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  31.61 
 
 
312 aa  95.5  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  36.84 
 
 
326 aa  95.1  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  30.83 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  30.36 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  30.38 
 
 
257 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  29.96 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  30.64 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  28.45 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  30.77 
 
 
205 aa  92  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  29.28 
 
 
279 aa  92  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  29.96 
 
 
257 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  29.96 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  29.96 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  35.37 
 
 
263 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  26.79 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  26.49 
 
 
214 aa  89  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  31.37 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  29.72 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.8 
 
 
214 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  29.81 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.02 
 
 
214 aa  86.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  27.45 
 
 
254 aa  86.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  31.16 
 
 
259 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  27.23 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  30.37 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  26.61 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  30.96 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  31.43 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  30.37 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  28.96 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  27.09 
 
 
277 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  29.27 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>