More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0829 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0829  SMF protein  100 
 
 		 302 aa  620  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000000494778  unclonable  0.00000053087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00299  SMF protein  55.37 
 
 		 295 aa  350  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0738024  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2199  SMF protein  56.51 
 
 		 295 aa  329  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000000109566  n/a   
 
 
 
NC_009667  Oant_0895  SMF family protein  57.51 
 
 		 277 aa  310  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0725141  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0181  hypothetical protein  51.6 
 
 		 294 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4391  SMF family protein  46.73 
 
 		 226 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  34.47 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  35.92 
 
 		 409 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5585  SMF family protein  40.49 
 
 		 314 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  32.73 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  39.56 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0031  DNA protecting protein DprA  37.86 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  39.02 
 
 		 336 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  36.41 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  34.87 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  36.05 
 
 		 385 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  37.85 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  33.7 
 
 		 366 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 369 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  37.38 
 
 		 406 aa  132  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  35.89 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  37.27 
 
 		 359 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 229 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  33.7 
 
 		 365 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 		 359 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.84 
 
 		 369 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  39.02 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 373 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  34.43 
 
 		 360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  36.55 
 
 		 394 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  38.07 
 
 		 377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  36.62 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  36.89 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  35.59 
 
 		 366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  37.86 
 
 		 399 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  38.05 
 
 		 389 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  37.39 
 
 		 374 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  39.02 
 
 		 401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  37.38 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  41.33 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  36.13 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  31.23 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  36.59 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  37.09 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  37.09 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  35.24 
 
 		 386 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  35.24 
 
 		 364 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  34.83 
 
 		 364 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.82 
 
 		 369 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  33.22 
 
 		 365 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  36.59 
 
 		 370 aa  125  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  38.59 
 
 		 380 aa  125  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  36.1 
 
 		 282 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  38.54 
 
 		 402 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1207  DNA processing protein DprA, putative  34.57 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.172047  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  38.54 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  37.86 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  34.48 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  34.48 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  37.14 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  38.35 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.91 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.8 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  38.8 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  37.07 
 
 		 365 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  36.89 
 
 		 361 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  32.78 
 
 		 389 aa  122  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  38.16 
 
 		 365 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  35.61 
 
 		 296 aa  122  9e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  33.66 
 
 		 363 aa  122  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  36.04 
 
 		 358 aa  122  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  36.41 
 
 		 361 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  36.11 
 
 		 386 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  37.56 
 
 		 365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 405 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  35.92 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  38.86 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  35.75 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  32.54 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  36.41 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  39.23 
 
 		 372 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  33.61 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  38.42 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  32.05 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  36.89 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.77 
 
 		 362 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  36.7 
 
 		 338 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  33.98 
 
 		 371 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  37.56 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  30.82 
 
 		 399 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  30.77 
 
 		 426 aa  119  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  36.59 
 
 		 379 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  36.1 
 
 		 433 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  36.02 
 
 		 381 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  37.07 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  38.92 
 
 		 370 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  34.58 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>