More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0753 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0753  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 
251 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  91.16 
 
 
249 aa  455  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0819  electron transfer flavoprotein subunit beta  81.93 
 
 
249 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  81.93 
 
 
249 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4880  electron transfer flavoprotein beta-subunit  82.33 
 
 
249 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1140  electron transfer flavoprotein subunit beta  81.93 
 
 
249 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5232  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  80.32 
 
 
249 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0937638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2159  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  75.5 
 
 
249 aa  381  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  72.29 
 
 
249 aa  371  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4010  electron transfer flavoprotein beta subunit  76.71 
 
 
249 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2532  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  75.1 
 
 
249 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.944652  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  73.9 
 
 
249 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2007  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  72.69 
 
 
249 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.89 
 
 
249 aa  363  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.49 
 
 
249 aa  362  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6309  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.89 
 
 
249 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.49 
 
 
249 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.68 
 
 
249 aa  360  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.08 
 
 
249 aa  359  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.08 
 
 
249 aa  359  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3561  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  75.1 
 
 
249 aa  358  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.528846  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0178  electron transfer flavoprotein beta-subunit  70.78 
 
 
249 aa  357  7e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1971  electron transfer flavoprotein, beta subunit  72.02 
 
 
248 aa  357  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1896  electron transfer flavoprotein, beta subunit  72.02 
 
 
248 aa  357  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3854  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  72.69 
 
 
249 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445723  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1011  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  71.6 
 
 
248 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4915  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  73.9 
 
 
249 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751979  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3033  electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.88 
 
 
249 aa  354  7.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9247  electron transfer flavoprotein beta subunit  72.69 
 
 
249 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0111601  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3196  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  70.78 
 
 
249 aa  346  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.410827  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0546  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.19 
 
 
253 aa  345  5e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2556  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.19 
 
 
253 aa  345  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629709  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  68 
 
 
249 aa  344  8e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  68.27 
 
 
249 aa  343  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2730  electron transfer flavoprotein subunit beta  67.87 
 
 
249 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0217  electron transfer flavoprotein beta subunit  67.59 
 
 
252 aa  343  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1691  electron transfer flavoprotein subunit beta  66.4 
 
 
253 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68.27 
 
 
249 aa  343  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0324  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.4 
 
 
253 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171629  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  69.48 
 
 
249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.87 
 
 
249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.87 
 
 
249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4827  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  74.7 
 
 
249 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.480726  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  68.27 
 
 
249 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1223  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.6 
 
 
249 aa  341  7e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal  0.15593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  68 
 
 
249 aa  340  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1989  Sigma 54 interacting domain protein  67.33 
 
 
251 aa  339  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.4 
 
 
249 aa  338  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.2 
 
 
249 aa  338  5e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3271  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.39 
 
 
249 aa  337  7e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.8 
 
 
249 aa  337  8e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.87 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2390  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.47 
 
 
249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.424195  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2550  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.59 
 
 
252 aa  336  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321051  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7298  electron transfer flavoprotein subunit beta  67.07 
 
 
249 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207608  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  65.86 
 
 
249 aa  334  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.07 
 
 
249 aa  334  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3143  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  334  7e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.2 
 
 
249 aa  334  7.999999999999999e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  333  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  67.07 
 
 
249 aa  332  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2427  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.4 
 
 
252 aa  333  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4307  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.07 
 
 
249 aa  333  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.67 
 
 
249 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.67 
 
 
249 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  66.27 
 
 
249 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  66.27 
 
 
249 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  66.27 
 
 
249 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  66.27 
 
 
249 aa  332  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  66.27 
 
 
249 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  66.27 
 
 
249 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0931  electron transfer flavoprotein, beta subunit  66.27 
 
 
249 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  66.27 
 
 
249 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3374  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.86 
 
 
249 aa  331  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3598  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.6 
 
 
249 aa  331  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2540  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.2 
 
 
249 aa  331  7.000000000000001e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011084 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85841  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  66.27 
 
 
249 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  330  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0938  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2168  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  329  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0160278  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25860  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.67 
 
 
249 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.064795  normal  0.177804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3781  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  328  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1998  ATPase  64.66 
 
 
249 aa  328  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00163986  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0762  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  328  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2209  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.07 
 
 
249 aa  328  5.0000000000000004e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0583  electron transfer flavoprotein beta-subunit  66.27 
 
 
249 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0998  electron transfer flavoprotein subunit beta  66.27 
 
 
249 aa  328  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740496  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2093  electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.66 
 
 
249 aa  328  6e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0793  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  327  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  0.477243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  327  9e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2550  electron transfer flavoprotein subunit beta  65.46 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0737  electron transfer flavoprotein beta-subunit  64.66 
 
 
267 aa  326  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0122378  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2707  electron transfer flavoprotein beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  325  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462646  normal  0.372016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3526  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.46 
 
 
249 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6870  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  65.06 
 
 
249 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562162  normal  0.410167 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5519  electron transfer flavoprotein subunit beta  65.46 
 
 
249 aa  324  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4117  electron transfer flavoprotein subunit beta  65.86 
 
 
249 aa  324  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.838389  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1651  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  65.46 
 
 
249 aa  324  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>