More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0678 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  69.43 
 
 
580 aa  812    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  65.41 
 
 
574 aa  779    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  81.46 
 
 
582 aa  1014    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  65.02 
 
 
574 aa  788    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  67.31 
 
 
579 aa  799    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  100 
 
 
578 aa  1207    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  60.79 
 
 
569 aa  706    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  65.67 
 
 
576 aa  793    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  67.31 
 
 
579 aa  800    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  76.99 
 
 
591 aa  945    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  81.8 
 
 
582 aa  1016    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  69.43 
 
 
583 aa  823    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  67.03 
 
 
579 aa  782    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  67.49 
 
 
579 aa  801    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  64.69 
 
 
574 aa  781    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  67.2 
 
 
579 aa  784    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  87.37 
 
 
578 aa  1078    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  67.31 
 
 
579 aa  805    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  63.87 
 
 
574 aa  775    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  68.99 
 
 
578 aa  842    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  82.67 
 
 
580 aa  1024    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  63.87 
 
 
574 aa  775    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  67.03 
 
 
579 aa  784    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  55.04 
 
 
954 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  40.53 
 
 
610 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  36.75 
 
 
573 aa  353  5e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  28.06 
 
 
574 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.97 
 
 
579 aa  204  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.23 
 
 
594 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.29 
 
 
556 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.27 
 
 
563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.49 
 
 
566 aa  156  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.08 
 
 
590 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  26.65 
 
 
635 aa  151  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.78 
 
 
564 aa  146  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  27.25 
 
 
635 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  25.66 
 
 
568 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.32 
 
 
591 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  25.12 
 
 
632 aa  137  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.64 
 
 
622 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.71 
 
 
625 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1425  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.27 
 
 
588 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00837732  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.08 
 
 
622 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.45 
 
 
634 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2108  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.42 
 
 
590 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018563  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1675  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.41 
 
 
588 aa  122  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.506283  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25 
 
 
567 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01353  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.5 
 
 
588 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2816  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.95 
 
 
588 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572429  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  27.07 
 
 
629 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.88 
 
 
588 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.563088  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.74 
 
 
567 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1633  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.69 
 
 
588 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00339414  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.69 
 
 
588 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0194037  normal  0.398143 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2510  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.98 
 
 
588 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000247676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1653  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.67 
 
 
588 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.91 
 
 
591 aa  117  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1928  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.69 
 
 
588 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.9 
 
 
563 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2271  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.69 
 
 
588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0457279  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2185  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.05 
 
 
588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00800222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1834  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.79 
 
 
588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00255629  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004114  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.32 
 
 
588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.13 
 
 
588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2517  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.79 
 
 
588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000102318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2630  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.79 
 
 
588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0015925  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.53 
 
 
567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1835  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.49 
 
 
588 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132672  normal  0.110124 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0785  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.05 
 
 
576 aa  115  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  24.83 
 
 
567 aa  114  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.9 
 
 
588 aa  114  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.7 
 
 
590 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.7 
 
 
590 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2883  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.7 
 
 
588 aa  113  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0212451  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2970  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.7 
 
 
588 aa  113  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.431118  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.53 
 
 
567 aa  113  9e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1382  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.7 
 
 
588 aa  113  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.332477  normal  0.921061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2217  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.09 
 
 
588 aa  113  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1612  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.09 
 
 
590 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1234  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.05 
 
 
588 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  22.77 
 
 
659 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1786  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.44 
 
 
588 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00696319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3102  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.85 
 
 
588 aa  110  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.45 
 
 
629 aa  110  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.47 
 
 
589 aa  110  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2197  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  24.39 
 
 
590 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223298  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.61 
 
 
627 aa  110  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  25.21 
 
 
624 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  24.02 
 
 
587 aa  109  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.34 
 
 
567 aa  108  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  24.68 
 
 
657 aa  108  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0642  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.7 
 
 
588 aa  107  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0828  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.71 
 
 
588 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0767  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.71 
 
 
588 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0793  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.71 
 
 
588 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83395  normal  0.0589165 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0890  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.71 
 
 
588 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0857  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.71 
 
 
588 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484772 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01873  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.1 
 
 
590 aa  107  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00659831  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.29 
 
 
588 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00170465  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0771  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.7 
 
 
588 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>