More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0539 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0539  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
307 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1055  glycosyl transferase family protein  83.71 
 
 
307 aa  567  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0151578  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  32.81 
 
 
708 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
455 aa  123  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.86 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
311 aa  93.2  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
983 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.66 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1628  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1625  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.68 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.97 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0044  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0042  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  30.43 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  40.2 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.54 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.12 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.11 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  26.69 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 
1264 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.45 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0211  glycosyltransferase  34.43 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3188  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  24.59 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  23.89 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.94 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4802  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858117  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 
268 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.2 
 
 
254 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.52 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 
553 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1385  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593757  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  28.67 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
1035 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
344 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 
289 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
1116 aa  67  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
1239 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
346 aa  67  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
663 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
501 aa  65.9  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
418 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2353  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.712246  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
329 aa  65.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
351 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.42 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>