More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0514 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
308 aa  633  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  92.86 
 
 
308 aa  591  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  83.66 
 
 
328 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  83.77 
 
 
309 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  82.35 
 
 
316 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  82.3 
 
 
308 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  80.46 
 
 
310 aa  517  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  74.59 
 
 
309 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  72.64 
 
 
314 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  72.31 
 
 
314 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  72 
 
 
317 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  70.43 
 
 
316 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  70.1 
 
 
316 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  70.43 
 
 
330 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  72.13 
 
 
326 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  67.97 
 
 
319 aa  431  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  68.9 
 
 
312 aa  425  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  68.56 
 
 
312 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  68.56 
 
 
312 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  66.01 
 
 
304 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  66.67 
 
 
304 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  65.69 
 
 
313 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  65.02 
 
 
305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  64.12 
 
 
303 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  65.67 
 
 
302 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  63.82 
 
 
313 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  63.25 
 
 
308 aa  391  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  59.87 
 
 
310 aa  384  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  60.98 
 
 
308 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  60.98 
 
 
308 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  60 
 
 
308 aa  378  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  60 
 
 
328 aa  374  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  60.78 
 
 
308 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  59.67 
 
 
308 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  58.22 
 
 
308 aa  362  5.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  59.28 
 
 
331 aa  360  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 
311 aa  343  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  54.69 
 
 
311 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0077  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 
303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  54.93 
 
 
309 aa  325  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  53.31 
 
 
304 aa  324  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  53.49 
 
 
300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0046  ornithine carbamoyltransferase  51.63 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.425573  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 
298 aa  316  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  51.48 
 
 
304 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
303 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  53.09 
 
 
309 aa  308  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  51.01 
 
 
305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  51.01 
 
 
305 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  53.62 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 
307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
311 aa  301  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
309 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
329 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
309 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
306 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
306 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  49.66 
 
 
307 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
306 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
306 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  48.12 
 
 
305 aa  298  6e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 
329 aa  298  9e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
309 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  49.02 
 
 
309 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
306 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
309 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
309 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
309 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
309 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
309 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
309 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  52.94 
 
 
306 aa  297  2e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
355 aa  296  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
306 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
309 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
309 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
305 aa  296  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
309 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
309 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 
312 aa  295  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
302 aa  295  5e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  48 
 
 
316 aa  295  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
312 aa  295  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  49.66 
 
 
306 aa  295  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 
315 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
309 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
301 aa  294  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  47.67 
 
 
316 aa  293  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  47.67 
 
 
316 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  48 
 
 
316 aa  293  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
309 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  47.67 
 
 
316 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
314 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
560 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 
312 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>