More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0298 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  69.8 
 
 
492 aa  702  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  77.14 
 
 
485 aa  752  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  87.5 
 
 
484 aa  841  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  70.78 
 
 
500 aa  702  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  72 
 
 
476 aa  694  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  76.74 
 
 
491 aa  726  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  77.94 
 
 
482 aa  752  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  77.17 
 
 
491 aa  733  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  94.07 
 
 
489 aa  934  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  86.68 
 
 
482 aa  833  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  88.26 
 
 
490 aa  838  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  94.23 
 
 
467 aa  811  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  71.98 
 
 
492 aa  697  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  75.21 
 
 
485 aa  729  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  72.73 
 
 
508 aa  704  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  80.04 
 
 
483 aa  741  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  82.57 
 
 
482 aa  739  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  94.76 
 
 
433 aa  822  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  71.75 
 
 
477 aa  719  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  83.18 
 
 
482 aa  749  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  77.8 
 
 
482 aa  714  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  74.49 
 
 
504 aa  691  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  81.59 
 
 
480 aa  744  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  100 
 
 
488 aa  987  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  73.05 
 
 
488 aa  717  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  53.75 
 
 
624 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  47.72 
 
 
478 aa  452  1e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  51.74 
 
 
442 aa  453  1e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  53.92 
 
 
463 aa  453  1e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  50.71 
 
 
520 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  51.1 
 
 
455 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  50.71 
 
 
523 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  51.1 
 
 
455 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  51.1 
 
 
455 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  50.71 
 
 
520 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  50.71 
 
 
520 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  48.76 
 
 
472 aa  444  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  50.34 
 
 
467 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  49.12 
 
 
469 aa  445  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  50.71 
 
 
521 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  50.86 
 
 
455 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  50.48 
 
 
523 aa  440  1e-122  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  50.47 
 
 
455 aa  440  1e-122  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  49.2 
 
 
451 aa  439  1e-122  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  50.33 
 
 
521 aa  439  1e-122  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  52.1 
 
 
441 aa  441  1e-122  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  50.46 
 
 
463 aa  438  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  51.35 
 
 
464 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  50.61 
 
 
454 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  50.49 
 
 
459 aa  438  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  50 
 
 
515 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  54.3 
 
 
437 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  49.06 
 
 
455 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  49.06 
 
 
455 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  51.96 
 
 
498 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  49.51 
 
 
456 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  49.44 
 
 
560 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  50.61 
 
 
454 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  50.45 
 
 
445 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  50.61 
 
 
454 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  50.61 
 
 
454 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  48.6 
 
 
474 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  51.75 
 
 
465 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  8.47512e-06 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  49.02 
 
 
453 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  49.76 
 
 
460 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  49.77 
 
 
445 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  48.67 
 
 
473 aa  422  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  51.99 
 
 
452 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  51.11 
 
 
479 aa  421  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  47.87 
 
 
428 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  56.15 
 
 
444 aa  421  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  50.12 
 
 
437 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  49.28 
 
 
462 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  50.49 
 
 
442 aa  418  1e-115  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  50.12 
 
 
437 aa  417  1e-115  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1126  type II secretion system protein E  49.11 
 
 
484 aa  416  1e-115  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188659  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  47.65 
 
 
454 aa  418  1e-115  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0994  type II secretion system protein E  47.72 
 
 
496 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.010804  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  46.36 
 
 
463 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  49.29 
 
 
450 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  51.72 
 
 
468 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  49.67 
 
 
608 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  52.01 
 
 
467 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  53.37 
 
 
477 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  53.65 
 
 
478 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  50.72 
 
 
521 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  49.39 
 
 
491 aa  412  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1833  type II secretion system protein E  51.31 
 
 
437 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  49.29 
 
 
452 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  52.09 
 
 
452 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  50 
 
 
677 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  47.94 
 
 
472 aa  408  1e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  49.75 
 
 
481 aa  406  1e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  48.66 
 
 
457 aa  407  1e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  53.77 
 
 
416 aa  406  1e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  52.34 
 
 
487 aa  408  1e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  49.74 
 
 
432 aa  407  1e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  48.92 
 
 
472 aa  407  1e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  48.92 
 
 
472 aa  407  1e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  45.09 
 
 
455 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>