180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0244 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  100 
 
 
241 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  74.18 
 
 
245 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  58.7 
 
 
251 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  64.52 
 
 
209 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  56.33 
 
 
242 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  54.58 
 
 
236 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  56.85 
 
 
238 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  54.88 
 
 
243 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  51.85 
 
 
240 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  53.94 
 
 
237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  52.28 
 
 
237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  51.84 
 
 
236 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  52.28 
 
 
243 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  54.13 
 
 
238 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  48.83 
 
 
241 aa  151  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  46.15 
 
 
193 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  42.08 
 
 
245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  40.65 
 
 
453 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  38.71 
 
 
452 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  31.73 
 
 
244 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  38.59 
 
 
237 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  37.3 
 
 
247 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  36.55 
 
 
243 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  35.02 
 
 
207 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  38.08 
 
 
274 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  33.98 
 
 
254 aa  99.4  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  34.16 
 
 
246 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  38.46 
 
 
447 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  37.2 
 
 
454 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  36.86 
 
 
997 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  34.47 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  35.61 
 
 
449 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  34.88 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  34.87 
 
 
241 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  31.46 
 
 
566 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  35.27 
 
 
255 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  32.82 
 
 
255 aa  92.8  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1567  putative outer-membrane protein precursor  37.07 
 
 
258 aa  92.4  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109724  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  37.45 
 
 
225 aa  92  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  32.89 
 
 
559 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  35.48 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  32.79 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  33.01 
 
 
661 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  33.21 
 
 
570 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  36.41 
 
 
212 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  33.05 
 
 
561 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  37.76 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  33.46 
 
 
248 aa  88.6  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  37.92 
 
 
235 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  34.26 
 
 
251 aa  89  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  32.34 
 
 
692 aa  88.6  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  33.76 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  31.09 
 
 
570 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  32.79 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  29.76 
 
 
562 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  34.98 
 
 
449 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  32.35 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  36.11 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  32.6 
 
 
652 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  33.99 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  33.84 
 
 
689 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  31.4 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2080  putative outer-membrane protein precursor  35.6 
 
 
251 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.366829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  34.31 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  34.08 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.78 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4376  putative outer-membrane protein  35.34 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36541  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  30.23 
 
 
250 aa  79  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  29.37 
 
 
578 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  37.25 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  33.17 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  34.15 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  30.38 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  31.09 
 
 
645 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.84 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  31 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  30.25 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  32.14 
 
 
638 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  35.29 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4525  putative outer-membrane protein  33.87 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  30.9 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  29.27 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  30.62 
 
 
571 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  30.9 
 
 
228 aa  72  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  33.33 
 
 
710 aa  71.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3979  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.08 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  33.67 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6718  hypothetical protein  33.33 
 
 
550 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  34.12 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  31.02 
 
 
674 aa  69.7  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  33.09 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  33.69 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  31.05 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  29.02 
 
 
693 aa  68.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  35.15 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  31.63 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  31.34 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  33.18 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  29.24 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  26.89 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>