213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0184 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  658    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  80.72 
 
 
308 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  89.54 
 
 
308 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  80.26 
 
 
308 aa  457  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  79.21 
 
 
307 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  75.08 
 
 
320 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  76.32 
 
 
307 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  56.19 
 
 
308 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  55.52 
 
 
307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  54.18 
 
 
305 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  60.93 
 
 
307 aa  311  7.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  54.43 
 
 
307 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  54.52 
 
 
307 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  50.66 
 
 
307 aa  288  7e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  51.84 
 
 
306 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  51.84 
 
 
306 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  49.35 
 
 
307 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  53.18 
 
 
316 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  54.52 
 
 
306 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  52.84 
 
 
316 aa  280  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  53.18 
 
 
306 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  49.01 
 
 
306 aa  275  6e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  48.71 
 
 
310 aa  270  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  50.77 
 
 
330 aa  266  5e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  49.5 
 
 
307 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  53.27 
 
 
307 aa  255  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  42.76 
 
 
315 aa  237  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  53.27 
 
 
307 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  44.85 
 
 
304 aa  229  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  50 
 
 
307 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  42.05 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  39.53 
 
 
305 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  39.66 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  42.28 
 
 
312 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  40.4 
 
 
303 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  32.46 
 
 
313 aa  149  6e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  40.6 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  36.52 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  29.83 
 
 
420 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  33.22 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  26.53 
 
 
426 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 
352 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  29.75 
 
 
300 aa  87.8  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  29.12 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  26.37 
 
 
257 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  29.26 
 
 
356 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  26.69 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  28.67 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  26.5 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  26.41 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  26.62 
 
 
427 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  26.91 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  27.66 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  28.25 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  27.55 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  25.84 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  27.14 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  27.88 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  28.02 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  28.33 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  24.83 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  23.05 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  23.69 
 
 
254 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  23.38 
 
 
257 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  23.32 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  25.9 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  24.36 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  27.93 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  25.27 
 
 
251 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  25.27 
 
 
251 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  27.34 
 
 
261 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  28.18 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.26 
 
 
266 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  27.59 
 
 
2798 aa  62.8  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  24.91 
 
 
346 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0941  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.892204  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  26.81 
 
 
255 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  23.98 
 
 
275 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  23.98 
 
 
275 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  24.32 
 
 
264 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  27.3 
 
 
255 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  26.07 
 
 
356 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0872  hypothetical protein  24.21 
 
 
254 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  27.36 
 
 
270 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  26.67 
 
 
355 aa  59.3  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  22.39 
 
 
345 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0089  protein of unknown function DUF81  26.4 
 
 
317 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2888  protein of unknown function DUF81  27.05 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  28.62 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  32.69 
 
 
242 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  23.83 
 
 
309 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  28.72 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  26.16 
 
 
261 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  25.84 
 
 
263 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  26.74 
 
 
360 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  27.93 
 
 
270 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0309  hypothetical protein  26.09 
 
 
319 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  23.21 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  22.99 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  26.17 
 
 
269 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>