More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0183 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  52.49 
 
 
1160 aa  936    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 
1059 aa  2114    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  57.48 
 
 
1105 aa  969    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  55.7 
 
 
1105 aa  947    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  56.74 
 
 
1134 aa  952    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  73 
 
 
1086 aa  1379    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  56.93 
 
 
1110 aa  446  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  29.33 
 
 
978 aa  241  8e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.6 
 
 
1226 aa  223  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.19 
 
 
1196 aa  219  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.91 
 
 
1263 aa  205  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.07 
 
 
1260 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3570  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50.72 
 
 
1110 aa  197  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571273  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3246  Sel1 domain-containing protein  50.72 
 
 
1145 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00516483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  46.4 
 
 
1242 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  53.19 
 
 
1088 aa  195  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.76 
 
 
1012 aa  193  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  47.96 
 
 
1275 aa  192  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  44.26 
 
 
1081 aa  190  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  50.75 
 
 
795 aa  175  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  26.14 
 
 
913 aa  155  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  44.81 
 
 
1003 aa  155  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0265  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.15 
 
 
884 aa  135  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0121173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.14 
 
 
1072 aa  135  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.67 
 
 
318 aa  131  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  43.79 
 
 
684 aa  130  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  42.31 
 
 
831 aa  129  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  38.96 
 
 
1037 aa  128  6e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  38.61 
 
 
235 aa  124  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  40.65 
 
 
305 aa  124  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  40.38 
 
 
2413 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  40.27 
 
 
789 aa  122  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  36.26 
 
 
241 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  41.18 
 
 
557 aa  121  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  39.1 
 
 
416 aa  121  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  41.4 
 
 
961 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  37.09 
 
 
1877 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  38.89 
 
 
329 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  39.22 
 
 
1493 aa  119  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  40.52 
 
 
393 aa  118  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  42.11 
 
 
1910 aa  118  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  40.88 
 
 
185 aa  118  6.9999999999999995e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.5 
 
 
528 aa  117  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  37.91 
 
 
264 aa  116  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  43.14 
 
 
489 aa  116  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.96 
 
 
1402 aa  115  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 
303 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  41.56 
 
 
425 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.2 
 
 
321 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  40.13 
 
 
490 aa  112  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  38.96 
 
 
232 aa  112  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  40.13 
 
 
490 aa  111  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 
1032 aa  110  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  37.5 
 
 
256 aa  110  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  40.4 
 
 
1002 aa  110  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  39.22 
 
 
376 aa  109  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  38.41 
 
 
271 aa  110  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  38.56 
 
 
838 aa  108  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.22 
 
 
343 aa  108  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  37.64 
 
 
254 aa  108  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
448 aa  108  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  39.22 
 
 
376 aa  107  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.07 
 
 
341 aa  107  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  41.56 
 
 
685 aa  106  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  35.26 
 
 
293 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  36.18 
 
 
252 aa  106  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 
763 aa  105  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  36.24 
 
 
267 aa  105  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.16 
 
 
193 aa  103  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  38.73 
 
 
208 aa  103  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  35.48 
 
 
342 aa  102  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.99 
 
 
346 aa  102  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.63 
 
 
997 aa  101  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  37.01 
 
 
552 aa  100  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  34.39 
 
 
218 aa  100  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 
464 aa  100  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.31 
 
 
325 aa  99.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  38.31 
 
 
325 aa  99.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  35.95 
 
 
246 aa  99.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  41.78 
 
 
301 aa  99  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.99 
 
 
392 aa  98.6  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  35.03 
 
 
373 aa  98.6  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  38.4 
 
 
181 aa  98.6  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
222 aa  98.6  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
1430 aa  98.6  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.58 
 
 
316 aa  98.6  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.73 
 
 
278 aa  97.8  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  34.19 
 
 
348 aa  97.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  39.61 
 
 
255 aa  97.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  41.06 
 
 
276 aa  96.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  36.24 
 
 
303 aa  96.7  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 
231 aa  96.3  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  42.47 
 
 
976 aa  95.9  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  37.66 
 
 
285 aa  95.9  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  33.9 
 
 
373 aa  95.1  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.6 
 
 
380 aa  94.4  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  37.43 
 
 
359 aa  94  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 
344 aa  94  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  37.42 
 
 
274 aa  93.6  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  35.76 
 
 
380 aa  93.2  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>