More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0167 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 190 aa  381  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  74.74 
 
 		 212 aa  282  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.19 
 
 		 568 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  55.19 
 
 		 568 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  57.54 
 
 		 1215 aa  204  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  57.92 
 
 		 1328 aa  204  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  55.62 
 
 		 751 aa  201  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  56.35 
 
 		 919 aa  200  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.25 
 
 		 787 aa  198  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  52.46 
 
 		 767 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  54.64 
 
 		 1507 aa  193  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  54.64 
 
 		 911 aa  192  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  52.41 
 
 		 454 aa  193  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  53.63 
 
 		 311 aa  192  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  51.91 
 
 		 672 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  56.42 
 
 		 771 aa  189  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  55.62 
 
 		 362 aa  185  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  53.63 
 
 		 725 aa  180  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  53.07 
 
 		 785 aa  179  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  50.81 
 
 		 444 aa  178  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  47.25 
 
 		 924 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.28 
 
 		 991 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  49.72 
 
 		 825 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  49.16 
 
 		 1039 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.12 
 
 		 1424 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  48.09 
 
 		 481 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  49.72 
 
 		 843 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  43.46 
 
 		 1105 aa  168  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.12 
 
 		 885 aa  167  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.31 
 
 		 1186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  48.63 
 
 		 680 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  46.71 
 
 		 284 aa  157  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  45.36 
 
 		 799 aa  156  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  46.37 
 
 		 1044 aa  154  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 814 aa  152  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  42.2 
 
 		 1288 aa  151  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  45.9 
 
 		 977 aa  147  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  42.2 
 
 		 1131 aa  144  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  37.83 
 
 		 822 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  40.22 
 
 		 493 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  38.73 
 
 		 1050 aa  131  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 		 667 aa  131  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  43.62 
 
 		 162 aa  131  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  39.44 
 
 		 669 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  35.26 
 
 		 1262 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 443 aa  121  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 953 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  34.03 
 
 		 1185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  37.21 
 
 		 1475 aa  117  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  37.57 
 
 		 1290 aa  117  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  38.89 
 
 		 1128 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  37.28 
 
 		 1040 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  36.09 
 
 		 304 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  34.44 
 
 		 1125 aa  112  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  32.96 
 
 		 1550 aa  112  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  41.07 
 
 		 1028 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  34.62 
 
 		 732 aa  111  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  36.14 
 
 		 1488 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5157  hypothetical protein  36.48 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1510  TPR repeat-containing protein  41.36 
 
 		 303 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0607189 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  32.96 
 
 		 2145 aa  108  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 949 aa  108  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  35.39 
 
 		 937 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  33.33 
 
 		 694 aa  105  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  30.32 
 
 		 577 aa  105  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  30.18 
 
 		 828 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 776 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  39.43 
 
 		 1036 aa  101  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  35.56 
 
 		 963 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 469 aa  99.4  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  31.64 
 
 		 1212 aa  98.6  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  30 
 
 		 740 aa  96.7  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  32.97 
 
 		 919 aa  95.1  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  32.54 
 
 		 1056 aa  94.4  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 1088 aa  92  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.76 
 
 		 854 aa  91.3  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  38.84 
 
 		 900 aa  90.9  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  36.16 
 
 		 801 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.16 
 
 		 968 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  30.19 
 
 		 807 aa  90.1  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  33.53 
 
 		 1136 aa  85.9  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  35.03 
 
 		 1283 aa  86.3  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05237  conserved hypothetical protein  37.93 
 
 		 551 aa  85.5  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00419082  hitchhiker  0.0029586 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.17 
 
 		 2413 aa  85.1  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1068 aa  84.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1404 aa  84.7  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 640 aa  84.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  27.93 
 
 		 708 aa  83.6  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 837 aa  82  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33193  predicted protein  30.18 
 
 		 885 aa  82  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.627765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  30.56 
 
 		 1228 aa  82  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1818  TPR repeat-containing protein  41.3 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5235  predicted protein  32.54 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.929624  normal  0.933998 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 851 aa  79  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  32.98 
 
 		 686 aa  79  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  31.14 
 
 		 1106 aa  78.6  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5384  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 		 1109 aa  78.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00425552  normal  0.786393 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  33.14 
 
 		 1146 aa  78.2  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08563  conserved hypothetical protein  32.35 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885943 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1530  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>